24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1641 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1641  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  535  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0602  hypothetical protein  42.97 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2199  hypothetical protein  43.15 
 
 		 272 aa  169  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.321366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1464  hypothetical protein  42.54 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1010  hypothetical protein  39.37 
 
 		 241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.708438 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2257  hypothetical protein  39.57 
 
 		 268 aa  145  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.448335  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4932  hypothetical protein  38.46 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2527  hypothetical protein  27.98 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0304  hypothetical protein  30.22 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0768  hypothetical protein  25.12 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.022382  normal  0.202851 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04757  Coenzyme Q (ubiquinone) biosynthesis protein Coq4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06410)  27.51 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08681  hypothetical protein  25 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0459  hypothetical protein  27.75 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.973172  normal  0.217109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1635  hypothetical protein  26.99 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0142491  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1400  hypothetical protein  24.44 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1094  hypothetical protein  23.87 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.117694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0855  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  28.48 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90569  predicted protein  24.16 
 
 		 320 aa  52.4  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.452398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4821  hypothetical protein  24.2 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3834  hypothetical protein  31.06 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20781  hypothetical protein  25 
 
 		 222 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0058  hypothetical protein  27.04 
 
 		 253 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0056  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  27.04 
 
 		 253 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0107681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2142  hypothetical protein  22.17 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  0.620619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>