29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1400 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1400  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4821  hypothetical protein  32.35 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1635  hypothetical protein  32.13 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0142491  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1094  hypothetical protein  33.17 
 
 		 232 aa  118  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.117694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2527  hypothetical protein  31.41 
 
 		 222 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0855  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  28.12 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0768  hypothetical protein  27.91 
 
 		 218 aa  94.7  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.022382  normal  0.202851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0459  hypothetical protein  27.27 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.973172  normal  0.217109 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0056  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  27.06 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0107681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0058  hypothetical protein  27.06 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0304  hypothetical protein  31.18 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3834  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20781  hypothetical protein  25.73 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2142  hypothetical protein  25.23 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08681  hypothetical protein  21.05 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3628  hypothetical protein  23.08 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1464  hypothetical protein  26.97 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90569  predicted protein  25.6 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.452398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1641  hypothetical protein  24.44 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04757  Coenzyme Q (ubiquinone) biosynthesis protein Coq4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06410)  23.83 
 
 		 316 aa  53.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119511  Ubiquinone biosynthesis protein COQ4-like protein  22.84 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1010  hypothetical protein  23.13 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.708438 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3348  hypothetical protein  24.17 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2199  hypothetical protein  23.6 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.321366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2257  hypothetical protein  23.68 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.448335  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03000  ubiquinone metabolism-related protein, putative  21.47 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_38985  predicted protein  20 
 
 		 254 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3728  hypothetical protein  22.95 
 
 		 273 aa  42.4  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4932  hypothetical protein  22.22 
 
 		 241 aa  42  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>