30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0459 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0459  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.973172  normal  0.217109 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0768  hypothetical protein  43.14 
 
 
218 aa  175  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.022382  normal  0.202851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2527  hypothetical protein  43.46 
 
 
222 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4821  hypothetical protein  37.37 
 
 
248 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0855  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  36.63 
 
 
247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1635  hypothetical protein  34.8 
 
 
235 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0142491  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1094  hypothetical protein  34.67 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.117694  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20781  hypothetical protein  38.51 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08681  hypothetical protein  32.45 
 
 
219 aa  111  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0304  hypothetical protein  34.04 
 
 
215 aa  106  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0056  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  28.08 
 
 
253 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0107681  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0058  hypothetical protein  28.08 
 
 
253 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1400  hypothetical protein  27.27 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2142  hypothetical protein  25.45 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3834  hypothetical protein  34.29 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3728  hypothetical protein  26.02 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3628  hypothetical protein  27.23 
 
 
272 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2257  hypothetical protein  26.64 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.448335  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04757  Coenzyme Q (ubiquinone) biosynthesis protein Coq4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06410)  29.61 
 
 
316 aa  63.2  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3348  hypothetical protein  27.17 
 
 
277 aa  62.4  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1010  hypothetical protein  27.11 
 
 
241 aa  59.3  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.708438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1641  hypothetical protein  27.75 
 
 
264 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90569  predicted protein  24.68 
 
 
320 aa  55.5  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.452398  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2199  hypothetical protein  32.17 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.321366  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_38985  predicted protein  26.81 
 
 
254 aa  53.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03000  ubiquinone metabolism-related protein, putative  22.35 
 
 
300 aa  52.8  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1464  hypothetical protein  26.21 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3630  hypothetical protein  28.57 
 
 
292 aa  46.6  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55838  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119511  Ubiquinone biosynthesis protein COQ4-like protein  37.97 
 
 
224 aa  46.2  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4932  hypothetical protein  26.8 
 
 
241 aa  42.4  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>