18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4932 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4932  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1010  hypothetical protein  79.67 
 
 
241 aa  398  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.708438 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1464  hypothetical protein  48.6 
 
 
260 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1641  hypothetical protein  38.46 
 
 
264 aa  148  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2199  hypothetical protein  37.67 
 
 
272 aa  128  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.321366  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2257  hypothetical protein  36.24 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.448335  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0602  hypothetical protein  34.57 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90569  predicted protein  25.97 
 
 
320 aa  60.1  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.452398  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04757  Coenzyme Q (ubiquinone) biosynthesis protein Coq4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06410)  27.27 
 
 
316 aa  56.6  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_38985  predicted protein  29.89 
 
 
254 aa  53.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3728  hypothetical protein  28.22 
 
 
273 aa  49.7  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2527  hypothetical protein  25.96 
 
 
222 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0855  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  26.53 
 
 
247 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1400  hypothetical protein  22.22 
 
 
220 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20781  hypothetical protein  29.09 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4821  hypothetical protein  24.62 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0459  hypothetical protein  25.79 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.973172  normal  0.217109 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3630  hypothetical protein  34.72 
 
 
292 aa  42.4  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>