17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3630 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3630  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  612  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55838  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3277  hypothetical protein  54.77 
 
 
297 aa  305  7e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625674  normal  0.209771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3348  hypothetical protein  40 
 
 
277 aa  193  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3728  hypothetical protein  38.52 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3628  hypothetical protein  29.18 
 
 
272 aa  122  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3710  hypothetical protein  30.04 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0407682  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4821  hypothetical protein  29.94 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3834  hypothetical protein  26.58 
 
 
253 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0056  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  25.27 
 
 
253 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0107681  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0058  hypothetical protein  25.27 
 
 
253 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2527  hypothetical protein  27.12 
 
 
222 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0459  hypothetical protein  28.57 
 
 
228 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.973172  normal  0.217109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1635  hypothetical protein  31.86 
 
 
235 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0142491  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1464  hypothetical protein  27.04 
 
 
260 aa  46.2  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1010  hypothetical protein  34.72 
 
 
241 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.708438 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0855  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  31.86 
 
 
247 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4932  hypothetical protein  34.72 
 
 
241 aa  42.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>