14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3277 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3277  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  617  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625674  normal  0.209771 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3630  hypothetical protein  54.77 
 
 		 292 aa  317  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55838  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3348  hypothetical protein  38.55 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3728  hypothetical protein  36.14 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3710  hypothetical protein  31.56 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0407682  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3628  hypothetical protein  28.35 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4821  hypothetical protein  28.95 
 
 		 248 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1635  hypothetical protein  30.51 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0142491  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3834  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2527  hypothetical protein  41.86 
 
 		 222 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0855  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  27.52 
 
 		 247 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0459  hypothetical protein  24.87 
 
 		 228 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.973172  normal  0.217109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0058  hypothetical protein  26 
 
 		 253 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0056  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  26 
 
 		 253 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0107681  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>