22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3728 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3728  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  566  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3348  hypothetical protein  59.93 
 
 		 277 aa  335  5e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3630  hypothetical protein  38.52 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55838  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3277  hypothetical protein  36.14 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625674  normal  0.209771 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3628  hypothetical protein  31.17 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3710  hypothetical protein  31.06 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0407682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0459  hypothetical protein  26.02 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.973172  normal  0.217109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4821  hypothetical protein  26.78 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0855  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  26.03 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0058  hypothetical protein  25.68 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0056  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  25.68 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0107681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0768  hypothetical protein  24.29 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.022382  normal  0.202851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1635  hypothetical protein  30.6 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0142491  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1010  hypothetical protein  26.75 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.708438 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90569  predicted protein  26.15 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.452398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1094  hypothetical protein  27.27 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.117694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20781  hypothetical protein  23.23 
 
 		 222 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2527  hypothetical protein  25.46 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3834  hypothetical protein  25.67 
 
 		 253 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4932  hypothetical protein  28.71 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2142  hypothetical protein  27.08 
 
 		 253 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1400  hypothetical protein  22.95 
 
 		 220 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>