29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0768 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0768  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  438  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.022382  normal  0.202851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0459  hypothetical protein  43.14 
 
 
228 aa  175  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.973172  normal  0.217109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1635  hypothetical protein  32.06 
 
 
235 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0142491  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4821  hypothetical protein  32.06 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0855  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  33.7 
 
 
247 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2527  hypothetical protein  32.81 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1094  hypothetical protein  28.26 
 
 
232 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.117694  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0304  hypothetical protein  31.8 
 
 
215 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1400  hypothetical protein  27.91 
 
 
220 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2142  hypothetical protein  29.27 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20781  hypothetical protein  26.79 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08681  hypothetical protein  26.15 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0056  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  28.91 
 
 
253 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0107681  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0058  hypothetical protein  28.91 
 
 
253 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3834  hypothetical protein  32.73 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90569  predicted protein  26.79 
 
 
320 aa  68.9  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.452398  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04757  Coenzyme Q (ubiquinone) biosynthesis protein Coq4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06410)  31.13 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1641  hypothetical protein  25.12 
 
 
264 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2199  hypothetical protein  26.73 
 
 
272 aa  60.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.321366  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03000  ubiquinone metabolism-related protein, putative  25.58 
 
 
300 aa  58.2  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3348  hypothetical protein  23.6 
 
 
277 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_38985  predicted protein  24.86 
 
 
254 aa  55.5  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3728  hypothetical protein  24.29 
 
 
273 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3628  hypothetical protein  28.57 
 
 
272 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2257  hypothetical protein  26.8 
 
 
268 aa  52.4  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.448335  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1464  hypothetical protein  27.62 
 
 
260 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3710  hypothetical protein  25.89 
 
 
284 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0407682  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.95 
 
 
501 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105421  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3630  hypothetical protein  19.64 
 
 
292 aa  41.6  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>