27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0304 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0304  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  428  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08681  hypothetical protein  40.65 
 
 
219 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2527  hypothetical protein  37.81 
 
 
222 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4821  hypothetical protein  37.27 
 
 
248 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0855  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  35.98 
 
 
247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1094  hypothetical protein  37.89 
 
 
232 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.117694  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0459  hypothetical protein  34.04 
 
 
228 aa  106  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.973172  normal  0.217109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1635  hypothetical protein  36.17 
 
 
235 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0142491  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0768  hypothetical protein  31.8 
 
 
218 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.022382  normal  0.202851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0058  hypothetical protein  27.6 
 
 
253 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0056  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  27.6 
 
 
253 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0107681  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20781  hypothetical protein  27.22 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1400  hypothetical protein  31.18 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3834  hypothetical protein  28.81 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2257  hypothetical protein  27.78 
 
 
268 aa  72  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.448335  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2142  hypothetical protein  24.4 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1641  hypothetical protein  30.22 
 
 
264 aa  65.5  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2199  hypothetical protein  27.67 
 
 
272 aa  56.6  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.321366  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1464  hypothetical protein  27.5 
 
 
260 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90569  predicted protein  23.28 
 
 
320 aa  54.3  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.452398  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04757  Coenzyme Q (ubiquinone) biosynthesis protein Coq4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06410)  30.43 
 
 
316 aa  50.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03000  ubiquinone metabolism-related protein, putative  24.14 
 
 
300 aa  47.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_38985  predicted protein  25.53 
 
 
254 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3348  hypothetical protein  28.21 
 
 
277 aa  45.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3628  hypothetical protein  26.2 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1010  hypothetical protein  29.37 
 
 
241 aa  42.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.708438 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119511  Ubiquinone biosynthesis protein COQ4-like protein  34.25 
 
 
224 aa  42.4  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>