24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2257 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2257  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  552  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.448335  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2199  hypothetical protein  50.39 
 
 
272 aa  258  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.321366  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1641  hypothetical protein  39.57 
 
 
264 aa  145  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0602  hypothetical protein  38.1 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1464  hypothetical protein  37.17 
 
 
260 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1010  hypothetical protein  36.87 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.708438 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4932  hypothetical protein  36.24 
 
 
241 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0304  hypothetical protein  27.78 
 
 
215 aa  72  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08681  hypothetical protein  23.61 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2527  hypothetical protein  25.56 
 
 
222 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0459  hypothetical protein  26.64 
 
 
228 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.973172  normal  0.217109 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20781  hypothetical protein  25.47 
 
 
222 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0058  hypothetical protein  26.98 
 
 
253 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0056  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  26.98 
 
 
253 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0107681  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0855  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  23.2 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3244  hypothetical protein  30.32 
 
 
171 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.532741  normal  0.598556 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0768  hypothetical protein  26.8 
 
 
218 aa  52.4  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.022382  normal  0.202851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3834  hypothetical protein  31.25 
 
 
253 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2142  hypothetical protein  26.04 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119511  Ubiquinone biosynthesis protein COQ4-like protein  32.38 
 
 
224 aa  45.4  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4821  hypothetical protein  27.72 
 
 
248 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1400  hypothetical protein  23.68 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1635  hypothetical protein  23.89 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0142491  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3628  hypothetical protein  26.86 
 
 
272 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>