23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2199 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2199  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  553  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.321366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2257  hypothetical protein  50.38 
 
 		 268 aa  262  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.448335  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1641  hypothetical protein  43.15 
 
 		 264 aa  169  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0602  hypothetical protein  43.16 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1464  hypothetical protein  43.32 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1010  hypothetical protein  38.43 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.708438 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4932  hypothetical protein  37.67 
 
 		 241 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08681  hypothetical protein  24.1 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0768  hypothetical protein  26.73 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.022382  normal  0.202851 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90569  predicted protein  27.32 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.452398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0058  hypothetical protein  28.36 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0056  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  28.36 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0107681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2527  hypothetical protein  32.18 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04757  Coenzyme Q (ubiquinone) biosynthesis protein Coq4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06410)  26.48 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0304  hypothetical protein  27.67 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0459  hypothetical protein  32.17 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.973172  normal  0.217109 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20781  hypothetical protein  26.99 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3244  hypothetical protein  35.29 
 
 		 171 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.532741  normal  0.598556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3834  hypothetical protein  27.61 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1400  hypothetical protein  23.6 
 
 		 220 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0855  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  25.79 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1094  hypothetical protein  25.49 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.117694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1635  hypothetical protein  24.55 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0142491  normal  0.703178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>