29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3834 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3834  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0056  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  66.27 
 
 
253 aa  352  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0107681  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0058  hypothetical protein  66.27 
 
 
253 aa  352  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2142  hypothetical protein  57.71 
 
 
253 aa  331  8e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2527  hypothetical protein  35.53 
 
 
222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1635  hypothetical protein  34.87 
 
 
235 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0142491  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4821  hypothetical protein  32.17 
 
 
248 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0855  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  35.36 
 
 
247 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1094  hypothetical protein  35.32 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.117694  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08681  hypothetical protein  29.46 
 
 
219 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0459  hypothetical protein  27.27 
 
 
228 aa  86.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.973172  normal  0.217109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1400  hypothetical protein  25.76 
 
 
220 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0304  hypothetical protein  28.81 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0768  hypothetical protein  31.71 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.022382  normal  0.202851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3348  hypothetical protein  29.41 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3630  hypothetical protein  26.58 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55838  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20781  hypothetical protein  23.79 
 
 
222 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3728  hypothetical protein  25.67 
 
 
273 aa  55.5  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2257  hypothetical protein  26.32 
 
 
268 aa  55.5  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.448335  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1641  hypothetical protein  27.01 
 
 
264 aa  52  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3628  hypothetical protein  25.32 
 
 
272 aa  52  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1464  hypothetical protein  25.69 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90569  predicted protein  25.14 
 
 
320 aa  48.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.452398  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2199  hypothetical protein  27.61 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.321366  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3710  hypothetical protein  25.61 
 
 
284 aa  46.6  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0407682  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04757  Coenzyme Q (ubiquinone) biosynthesis protein Coq4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06410)  23.5 
 
 
316 aa  45.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3277  hypothetical protein  26.84 
 
 
297 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625674  normal  0.209771 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0602  hypothetical protein  29.73 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0827  hypothetical protein  51.52 
 
 
101 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>