20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3628 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3628  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3710  hypothetical protein  47.57 
 
 
284 aa  256  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0407682  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3348  hypothetical protein  33.07 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3728  hypothetical protein  31.17 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3630  hypothetical protein  29.18 
 
 
292 aa  122  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55838  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3277  hypothetical protein  28.35 
 
 
297 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625674  normal  0.209771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0459  hypothetical protein  27.23 
 
 
228 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.973172  normal  0.217109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4821  hypothetical protein  27.74 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0855  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  28.57 
 
 
247 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1635  hypothetical protein  29.22 
 
 
235 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0142491  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1094  hypothetical protein  28.66 
 
 
232 aa  62.4  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.117694  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1400  hypothetical protein  23.08 
 
 
220 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2142  hypothetical protein  26.99 
 
 
253 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0768  hypothetical protein  28.57 
 
 
218 aa  53.5  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.022382  normal  0.202851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0058  hypothetical protein  24.7 
 
 
253 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0056  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  24.7 
 
 
253 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0107681  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2527  hypothetical protein  24.68 
 
 
222 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3834  hypothetical protein  25.32 
 
 
253 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2257  hypothetical protein  26.86 
 
 
268 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.448335  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0304  hypothetical protein  26.2 
 
 
215 aa  43.9  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>