21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3348 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3348  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  571  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3728  hypothetical protein  59.93 
 
 		 273 aa  335  5.999999999999999e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3630  hypothetical protein  40 
 
 		 292 aa  193  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55838  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3277  hypothetical protein  38.55 
 
 		 297 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625674  normal  0.209771 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3628  hypothetical protein  33.07 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3710  hypothetical protein  31.1 
 
 		 284 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0407682  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4821  hypothetical protein  29.65 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0855  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  38.02 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0058  hypothetical protein  29.29 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0056  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  29.29 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0107681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1094  hypothetical protein  28.5 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.117694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3834  hypothetical protein  28.79 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2527  hypothetical protein  27.75 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1635  hypothetical protein  29.03 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0142491  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0459  hypothetical protein  27.17 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.973172  normal  0.217109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2142  hypothetical protein  26.77 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0768  hypothetical protein  23.6 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.022382  normal  0.202851 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20781  hypothetical protein  22.82 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1400  hypothetical protein  24.17 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0304  hypothetical protein  28.21 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03000  ubiquinone metabolism-related protein, putative  22.64 
 
 		 300 aa  42  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>