23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1010 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1010  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  491  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.708438 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4932  hypothetical protein  79.67 
 
 		 241 aa  377  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1464  hypothetical protein  50 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1641  hypothetical protein  39.37 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2199  hypothetical protein  38.43 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.321366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2257  hypothetical protein  36.87 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.448335  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0602  hypothetical protein  34.18 
 
 		 273 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2527  hypothetical protein  28.76 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0459  hypothetical protein  27.11 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.973172  normal  0.217109 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90569  predicted protein  25.14 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.452398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1400  hypothetical protein  23.13 
 
 		 220 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3728  hypothetical protein  26.75 
 
 		 273 aa  52  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04757  Coenzyme Q (ubiquinone) biosynthesis protein Coq4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06410)  25.86 
 
 		 316 aa  50.1  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4821  hypothetical protein  24.71 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0855  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  25.65 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_38985  predicted protein  28.57 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119511  Ubiquinone biosynthesis protein COQ4-like protein  28.5 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0058  hypothetical protein  23.04 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0056  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  23.04 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0107681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20781  hypothetical protein  26.09 
 
 		 222 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1094  hypothetical protein  24.39 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.117694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3630  hypothetical protein  34.72 
 
 		 292 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55838  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0304  hypothetical protein  29.37 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>