17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_38985 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_38985  predicted protein  100 
 
 
254 aa  528  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04757  Coenzyme Q (ubiquinone) biosynthesis protein Coq4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06410)  41.01 
 
 
316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90569  predicted protein  34.53 
 
 
320 aa  145  9e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.452398  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03000  ubiquinone metabolism-related protein, putative  36.32 
 
 
300 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119511  Ubiquinone biosynthesis protein COQ4-like protein  32.08 
 
 
224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2527  hypothetical protein  27.88 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0855  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  28.57 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1635  hypothetical protein  28.18 
 
 
235 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0142491  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4821  hypothetical protein  26.11 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0768  hypothetical protein  24.86 
 
 
218 aa  55.5  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.022382  normal  0.202851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1094  hypothetical protein  26.09 
 
 
232 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.117694  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0459  hypothetical protein  26.81 
 
 
228 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.973172  normal  0.217109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1010  hypothetical protein  28.57 
 
 
241 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.708438 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20781  hypothetical protein  22.54 
 
 
222 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4932  hypothetical protein  28.11 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0304  hypothetical protein  25.53 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1400  hypothetical protein  20 
 
 
220 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>