39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4618 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4618  protein of unknown function DUF928  100 
 
 		 325 aa  666    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0153513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3788  protein of unknown function DUF928  35.58 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.578453 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4697  hypothetical protein  30.77 
 
 		 255 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1757  protein of unknown function DUF928  28.26 
 
 		 258 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.575148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4134  hypothetical protein  27.04 
 
 		 239 aa  90.1  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000576586  hitchhiker  0.00823671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1076  protein of unknown function DUF928  31.75 
 
 		 255 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184581 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2564  hypothetical protein  27.75 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4586  hypothetical protein  30.46 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.150151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0229  hypothetical protein  26.51 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3623  protein of unknown function DUF928  25.74 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3877  hypothetical protein  28.14 
 
 		 267 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00473154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1854  protein of unknown function DUF928  27.85 
 
 		 270 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1828  protein of unknown function DUF928  27.85 
 
 		 270 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4463  hypothetical protein  26.57 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2485  protein of unknown function DUF928  25.45 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1405  protein of unknown function DUF928  26.9 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769121 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0381  hypothetical protein  29.74 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2807  hypothetical protein  27.48 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.697152  normal  0.102514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4185  hypothetical protein  24.27 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1892  protein of unknown function DUF928  23 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000250467 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  45 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  36.59 
 
 		 751 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5805  protein of unknown function DUF928  26.7 
 
 		 219 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1636  Peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 109 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  36.36 
 
 		 590 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  43.64 
 
 		 203 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  47.92 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  39.19 
 
 		 360 aa  43.9  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  41.94 
 
 		 191 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  48.15 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1985  hypothetical protein  27.2 
 
 		 181 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  38.98 
 
 		 184 aa  43.1  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_46  putative cell wall degradation protein  43.4 
 
 		 739 aa  43.1  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169743  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  40.98 
 
 		 390 aa  42.7  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  35.05 
 
 		 295 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  39.68 
 
 		 602 aa  42.7  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  34 
 
 		 295 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  52.17 
 
 		 448 aa  42.7  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>