22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3877 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3877  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  546  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00473154  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3788  protein of unknown function DUF928  34.62 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.578453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0381  hypothetical protein  33.17 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1757  protein of unknown function DUF928  31.76 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.575148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1892  protein of unknown function DUF928  31.88 
 
 
278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000250467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2564  hypothetical protein  30.63 
 
 
350 aa  109  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4697  hypothetical protein  34.13 
 
 
255 aa  108  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670431  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4463  hypothetical protein  29.87 
 
 
284 aa  108  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4185  hypothetical protein  30.9 
 
 
258 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0229  hypothetical protein  30.5 
 
 
291 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1076  protein of unknown function DUF928  32.84 
 
 
255 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184581 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1828  protein of unknown function DUF928  29.89 
 
 
270 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1854  protein of unknown function DUF928  29.89 
 
 
270 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4134  hypothetical protein  26.98 
 
 
239 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000576586  hitchhiker  0.00823671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1405  protein of unknown function DUF928  28.5 
 
 
249 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769121 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4586  hypothetical protein  27.65 
 
 
249 aa  87  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.150151  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4618  protein of unknown function DUF928  28.04 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0153513 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3623  protein of unknown function DUF928  30.14 
 
 
241 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2485  protein of unknown function DUF928  31.41 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3058  protein of unknown function DUF928  24.62 
 
 
231 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5805  protein of unknown function DUF928  27.32 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1985  hypothetical protein  30.66 
 
 
181 aa  60.1  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>