17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1985 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1985  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  364  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3788  protein of unknown function DUF928  38.06 
 
 
249 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.578453 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4134  hypothetical protein  29.05 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000576586  hitchhiker  0.00823671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4697  hypothetical protein  33.06 
 
 
255 aa  72  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670431  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1757  protein of unknown function DUF928  28.72 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.575148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4586  hypothetical protein  32.5 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.150151  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0229  hypothetical protein  33.05 
 
 
291 aa  64.3  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1405  protein of unknown function DUF928  30.87 
 
 
249 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769121 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3623  protein of unknown function DUF928  30.17 
 
 
241 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3877  hypothetical protein  30.6 
 
 
267 aa  58.2  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00473154  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4185  hypothetical protein  29.21 
 
 
258 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2485  protein of unknown function DUF928  29.31 
 
 
241 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5805  protein of unknown function DUF928  27.11 
 
 
219 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2564  hypothetical protein  26.8 
 
 
350 aa  54.7  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1892  protein of unknown function DUF928  28.92 
 
 
278 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000250467 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4463  hypothetical protein  30.69 
 
 
284 aa  51.6  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4618  protein of unknown function DUF928  27.2 
 
 
325 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0153513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>