21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1892 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1892  protein of unknown function DUF928  100 
 
 
278 aa  571  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000250467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1854  protein of unknown function DUF928  35.71 
 
 
270 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1828  protein of unknown function DUF928  35.71 
 
 
270 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1405  protein of unknown function DUF928  33.18 
 
 
249 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3877  hypothetical protein  35.15 
 
 
267 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00473154  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4697  hypothetical protein  29.6 
 
 
255 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670431  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4586  hypothetical protein  34.09 
 
 
249 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.150151  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2564  hypothetical protein  27.73 
 
 
350 aa  99.8  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3788  protein of unknown function DUF928  29.67 
 
 
249 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.578453 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1076  protein of unknown function DUF928  29.44 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0381  hypothetical protein  29.33 
 
 
263 aa  93.2  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1757  protein of unknown function DUF928  29.82 
 
 
258 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.575148 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4463  hypothetical protein  27.62 
 
 
284 aa  86.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0229  hypothetical protein  28.9 
 
 
291 aa  85.5  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4134  hypothetical protein  26.09 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000576586  hitchhiker  0.00823671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3058  protein of unknown function DUF928  26.64 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3623  protein of unknown function DUF928  25.38 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2485  protein of unknown function DUF928  25.38 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4185  hypothetical protein  27.49 
 
 
258 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1985  hypothetical protein  28.92 
 
 
181 aa  52.4  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4618  protein of unknown function DUF928  23 
 
 
325 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0153513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>