20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3058 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3058  protein of unknown function DUF928  100 
 
 
231 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0381  hypothetical protein  30.16 
 
 
263 aa  96.7  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4697  hypothetical protein  27.08 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670431  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1892  protein of unknown function DUF928  26.64 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000250467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0229  hypothetical protein  28.95 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3877  hypothetical protein  24.62 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00473154  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1405  protein of unknown function DUF928  26.98 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4185  hypothetical protein  27.51 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3788  protein of unknown function DUF928  25.98 
 
 
249 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.578453 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4134  hypothetical protein  24.69 
 
 
239 aa  62  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000576586  hitchhiker  0.00823671 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4463  hypothetical protein  26.11 
 
 
284 aa  62  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2564  hypothetical protein  26.55 
 
 
350 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4586  hypothetical protein  26.82 
 
 
249 aa  59.3  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.150151  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1076  protein of unknown function DUF928  26.63 
 
 
255 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184581 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2485  protein of unknown function DUF928  27.6 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3623  protein of unknown function DUF928  27.08 
 
 
241 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1757  protein of unknown function DUF928  25.23 
 
 
258 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.575148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1828  protein of unknown function DUF928  26.13 
 
 
270 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1854  protein of unknown function DUF928  26.13 
 
 
270 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4618  protein of unknown function DUF928  22.95 
 
 
325 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0153513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>