22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1405 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1405  protein of unknown function DUF928  100 
 
 
249 aa  513  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769121 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4586  hypothetical protein  38.91 
 
 
249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.150151  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3788  protein of unknown function DUF928  37.12 
 
 
249 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.578453 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4697  hypothetical protein  31.96 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670431  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1892  protein of unknown function DUF928  33.18 
 
 
278 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000250467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1757  protein of unknown function DUF928  34.94 
 
 
258 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.575148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0381  hypothetical protein  29.05 
 
 
263 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4134  hypothetical protein  31.07 
 
 
239 aa  98.2  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000576586  hitchhiker  0.00823671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2564  hypothetical protein  28.3 
 
 
350 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1854  protein of unknown function DUF928  33.9 
 
 
270 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1828  protein of unknown function DUF928  33.9 
 
 
270 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3877  hypothetical protein  30.51 
 
 
267 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00473154  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2485  protein of unknown function DUF928  31.8 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0229  hypothetical protein  29.77 
 
 
291 aa  87  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4463  hypothetical protein  25.98 
 
 
284 aa  85.9  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3623  protein of unknown function DUF928  31.49 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1076  protein of unknown function DUF928  28.64 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184581 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4185  hypothetical protein  27.24 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3058  protein of unknown function DUF928  26.98 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4618  protein of unknown function DUF928  26.67 
 
 
325 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0153513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1985  hypothetical protein  30.87 
 
 
181 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5805  protein of unknown function DUF928  23.83 
 
 
219 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>