37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1942 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1942  putative bacteriophage-related protein  100 
 
 
136 aa  276  9e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1226  putative bacteriophage-related protein  48.31 
 
 
133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.856752  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2669  hypothetical protein  37.04 
 
 
137 aa  100  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2858  hypothetical protein  38.76 
 
 
138 aa  98.6  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.817778  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2618  hypothetical protein  36.03 
 
 
137 aa  99  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000782229  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2927  hypothetical protein  38.97 
 
 
144 aa  97.8  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.30294  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0897  LacI family regulatory protein  38.17 
 
 
139 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.238169  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2778  hypothetical protein  37.5 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3775  putative phage-related protein  36.51 
 
 
140 aa  92  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111218  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1936  putative phage-related protein  36.51 
 
 
140 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.46577  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2088  hypothetical protein  34.81 
 
 
137 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.217793  normal  0.0481295 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1422  LacI family regulatory protein  40.68 
 
 
145 aa  86.7  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1124  hypothetical protein  34.11 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2763  hypothetical protein  39.32 
 
 
172 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000498341 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1950  putative phage-related protein  38.98 
 
 
133 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2274  hypothetical protein  38.1 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429487  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0892  putative phage-related protein  44.17 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3231  hypothetical protein  35.25 
 
 
154 aa  76.6  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3248  putative bacteriophage-related protein  43.01 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.767846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3172  putative bacteriophage-related protein  44.09 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4308  hypothetical protein  66.04 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2633  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein, truncation  40.7 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2632  hypothetical protein  34.13 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  31.03 
 
 
500 aa  67  0.00000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2082  hypothetical protein  33.61 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0584139 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2834  hypothetical protein  32.79 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  31.82 
 
 
489 aa  63.2  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2273  hypothetical protein  33.59 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.647833  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3173  putative bacteriophage-related protein  36.63 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4118  hypothetical protein  31.31 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  33.33 
 
 
506 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  26.52 
 
 
545 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1399  putative bacteriophage-related protein  34.83 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4614  hypothetical protein  67.86 
 
 
78 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  28.12 
 
 
568 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4527  putative phage-related protein  48 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1580  hypothetical protein  27.13 
 
 
303 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>