45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1226 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1226  putative bacteriophage-related protein  100 
 
 
133 aa  272  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.856752  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1942  putative bacteriophage-related protein  48.31 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2669  hypothetical protein  42.19 
 
 
137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2618  hypothetical protein  42.19 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000782229  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2858  hypothetical protein  41.41 
 
 
138 aa  107  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.817778  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2778  hypothetical protein  38.41 
 
 
139 aa  99  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2927  hypothetical protein  37.96 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.30294  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1124  hypothetical protein  35.88 
 
 
138 aa  88.6  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2088  hypothetical protein  33.59 
 
 
137 aa  88.2  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.217793  normal  0.0481295 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0892  putative phage-related protein  36.89 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2763  hypothetical protein  40.48 
 
 
172 aa  84.7  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000498341 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0897  LacI family regulatory protein  35.11 
 
 
139 aa  84.3  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.238169  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1936  putative phage-related protein  36.22 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.46577  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3775  putative phage-related protein  36.22 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111218  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1422  LacI family regulatory protein  37.12 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2633  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein, truncation  45.35 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2274  hypothetical protein  36.84 
 
 
123 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429487  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2632  hypothetical protein  37.61 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3248  putative bacteriophage-related protein  39.53 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.767846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3172  putative bacteriophage-related protein  39.53 
 
 
124 aa  67  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4118  hypothetical protein  40.91 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  31.3 
 
 
500 aa  61.2  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  36.05 
 
 
489 aa  60.8  0.000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1950  putative phage-related protein  30.77 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  29.57 
 
 
506 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3231  hypothetical protein  30.89 
 
 
154 aa  57  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  28.69 
 
 
545 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2082  hypothetical protein  26.27 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0584139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4527  putative phage-related protein  43.4 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3173  putative bacteriophage-related protein  29.37 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2834  hypothetical protein  26.27 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2273  hypothetical protein  29.79 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.647833  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  25.2 
 
 
568 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2865  hypothetical protein  35.29 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal  0.608797 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  28.89 
 
 
532 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2796  hypothetical protein  37.08 
 
 
131 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197131  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4308  hypothetical protein  42.59 
 
 
171 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1580  hypothetical protein  23.26 
 
 
303 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0951  hypothetical protein  30.89 
 
 
174 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1215  hypothetical protein  30.89 
 
 
175 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.481243  hitchhiker  0.000377554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1399  putative bacteriophage-related protein  31.82 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0769  hypothetical protein  30.08 
 
 
177 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0885  hypothetical protein  28.35 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0749  hypothetical protein  29.27 
 
 
178 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0755  hypothetical protein  29.03 
 
 
178 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>