14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4308 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4308  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  345  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1942  putative bacteriophage-related protein  66.04 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4614  hypothetical protein  81.63 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0897  LacI family regulatory protein  38.33 
 
 		 139 aa  48.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.238169  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1936  putative phage-related protein  38.98 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.46577  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3775  putative phage-related protein  38.98 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2618  hypothetical protein  37.7 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000782229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2669  hypothetical protein  37.7 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2858  hypothetical protein  37.7 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.817778  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1226  putative bacteriophage-related protein  42.59 
 
 		 133 aa  45.1  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.856752  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3231  hypothetical protein  36.67 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1124  hypothetical protein  35.71 
 
 		 138 aa  40.8  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1422  LacI family regulatory protein  37.7 
 
 		 145 aa  40.8  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2763  hypothetical protein  34.43 
 
 		 172 aa  40.8  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>