37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2669 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2669  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  273  5e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2618  hypothetical protein  98.54 
 
 
137 aa  270  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000782229  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2858  hypothetical protein  93.43 
 
 
138 aa  254  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.817778  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1226  putative bacteriophage-related protein  42.19 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.856752  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2778  hypothetical protein  38.69 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2927  hypothetical protein  37.23 
 
 
144 aa  104  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.30294  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1942  putative bacteriophage-related protein  37.04 
 
 
136 aa  100  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1124  hypothetical protein  38.06 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2088  hypothetical protein  36.57 
 
 
137 aa  94  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.217793  normal  0.0481295 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0897  LacI family regulatory protein  36.22 
 
 
139 aa  94  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.238169  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0892  putative phage-related protein  36.8 
 
 
158 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3775  putative phage-related protein  35.94 
 
 
140 aa  90.9  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111218  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1936  putative phage-related protein  35.94 
 
 
140 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.46577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2763  hypothetical protein  41.13 
 
 
172 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000498341 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1422  LacI family regulatory protein  35.88 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3231  hypothetical protein  37.6 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  36.28 
 
 
500 aa  72.8  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  36.04 
 
 
489 aa  71.6  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1950  putative phage-related protein  28.69 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2274  hypothetical protein  32.48 
 
 
123 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429487  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2633  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein, truncation  37.21 
 
 
127 aa  67  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1399  putative bacteriophage-related protein  42.05 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3248  putative bacteriophage-related protein  37.5 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.767846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3172  putative bacteriophage-related protein  34.83 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  30.83 
 
 
532 aa  62  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2632  hypothetical protein  36.17 
 
 
154 aa  60.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2273  hypothetical protein  32 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.647833  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  28.91 
 
 
545 aa  57.8  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4118  hypothetical protein  33.7 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  32.73 
 
 
549 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  33.33 
 
 
550 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2082  hypothetical protein  22.58 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0584139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3173  putative bacteriophage-related protein  31.91 
 
 
157 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2834  hypothetical protein  26.83 
 
 
127 aa  50.1  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4308  hypothetical protein  37.7 
 
 
171 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  27.17 
 
 
506 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  43.4 
 
 
568 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>