42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1936 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1936  putative phage-related protein  100 
 
 		 140 aa  284  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.46577  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3775  putative phage-related protein  99.29 
 
 		 140 aa  283  5.999999999999999e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0897  LacI family regulatory protein  73.72 
 
 		 139 aa  214  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.238169  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2927  hypothetical protein  44.78 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.30294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2778  hypothetical protein  44.44 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0892  putative phage-related protein  35.61 
 
 		 158 aa  93.6  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1942  putative bacteriophage-related protein  36.51 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2669  hypothetical protein  35.94 
 
 		 137 aa  90.5  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2618  hypothetical protein  33.07 
 
 		 137 aa  90.1  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000782229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1422  LacI family regulatory protein  36.96 
 
 		 145 aa  88.6  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2858  hypothetical protein  34.88 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.817778  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1124  hypothetical protein  36.43 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2088  hypothetical protein  35.43 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.217793  normal  0.0481295 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3231  hypothetical protein  33.83 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1226  putative bacteriophage-related protein  36.22 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.856752  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2763  hypothetical protein  35.56 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3857  hypothetical protein  70.18 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.021633  normal  0.0299401 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  36.44 
 
 		 489 aa  73.2  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2082  hypothetical protein  29.66 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0584139 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  31.62 
 
 		 500 aa  68.2  0.00000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2632  hypothetical protein  34.07 
 
 		 154 aa  66.6  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1950  putative phage-related protein  29.91 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2633  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein, truncation  40.96 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2834  hypothetical protein  26.83 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3172  putative bacteriophage-related protein  34.52 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2274  hypothetical protein  30.33 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429487  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3248  putative bacteriophage-related protein  33.33 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.767846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4118  hypothetical protein  32.99 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  36.25 
 
 		 506 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2273  hypothetical protein  32.22 
 
 		 158 aa  52.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.647833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  29.59 
 
 		 545 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4308  hypothetical protein  38.98 
 
 		 171 aa  47  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  30.34 
 
 		 550 aa  47  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  37.04 
 
 		 568 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  28.8 
 
 		 549 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3173  putative bacteriophage-related protein  27.42 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1580  hypothetical protein  35.19 
 
 		 303 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1399  putative bacteriophage-related protein  30 
 
 		 93 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4527  putative phage-related protein  39.62 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1042  hypothetical protein  35.53 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1120  hypothetical protein  35.53 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0951  hypothetical protein  34.21 
 
 		 174 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>