31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1399 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1399  putative bacteriophage-related protein  100 
 
 
93 aa  180  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2273  hypothetical protein  59.09 
 
 
158 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.647833  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3173  putative bacteriophage-related protein  51.25 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2632  hypothetical protein  49.4 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2618  hypothetical protein  42.05 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000782229  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2858  hypothetical protein  42.05 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.817778  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2669  hypothetical protein  42.05 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2633  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein, truncation  39.08 
 
 
127 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3231  hypothetical protein  33.71 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2778  hypothetical protein  39.76 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2927  hypothetical protein  38.55 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.30294  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2763  hypothetical protein  45.76 
 
 
172 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000498341 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1124  hypothetical protein  34.52 
 
 
138 aa  53.5  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2088  hypothetical protein  34.52 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.217793  normal  0.0481295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1942  putative bacteriophage-related protein  34.83 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3248  putative bacteriophage-related protein  34.48 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.767846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3172  putative bacteriophage-related protein  35.63 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2274  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429487  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1950  putative phage-related protein  36.23 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  30.12 
 
 
489 aa  47.4  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2082  hypothetical protein  35.62 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0584139 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2834  hypothetical protein  34.25 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1422  LacI family regulatory protein  41.18 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  34.43 
 
 
500 aa  42.4  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1226  putative bacteriophage-related protein  31.82 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.856752  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3775  putative phage-related protein  30 
 
 
140 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111218  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1936  putative phage-related protein  30 
 
 
140 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.46577  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0892  putative phage-related protein  38.46 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2796  hypothetical protein  44 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197131  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0897  LacI family regulatory protein  30.49 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.238169  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2865  hypothetical protein  42 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal  0.608797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>