36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2927 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2927  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  290  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.30294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2778  hypothetical protein  97.08 
 
 		 139 aa  271  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2088  hypothetical protein  47.52 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.217793  normal  0.0481295 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1124  hypothetical protein  46.1 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0897  LacI family regulatory protein  44.78 
 
 		 139 aa  106  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.238169  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2858  hypothetical protein  36.17 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.817778  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2669  hypothetical protein  37.23 
 
 		 137 aa  104  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2618  hypothetical protein  36.5 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000782229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1936  putative phage-related protein  44.78 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.46577  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3775  putative phage-related protein  44.78 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1942  putative bacteriophage-related protein  38.97 
 
 		 136 aa  97.8  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1226  putative bacteriophage-related protein  37.96 
 
 		 133 aa  97.1  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.856752  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0892  putative phage-related protein  36.15 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1422  LacI family regulatory protein  36.84 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2763  hypothetical protein  37.8 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498341 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2273  hypothetical protein  38.81 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.647833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  35.34 
 
 		 500 aa  77  0.00000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  39.56 
 
 		 489 aa  73.9  0.0000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2632  hypothetical protein  32.56 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3231  hypothetical protein  31.75 
 
 		 154 aa  66.6  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3173  putative bacteriophage-related protein  30 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1950  putative phage-related protein  27.69 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2633  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein, truncation  35.71 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1399  putative bacteriophage-related protein  38.55 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  31.15 
 
 		 545 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2082  hypothetical protein  28.46 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0584139 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2834  hypothetical protein  28.46 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  30 
 
 		 506 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4118  hypothetical protein  30.3 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3248  putative bacteriophage-related protein  30.23 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.767846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2274  hypothetical protein  25.6 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429487  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3172  putative bacteriophage-related protein  29.07 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  28.99 
 
 		 568 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1580  hypothetical protein  28.26 
 
 		 303 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  28.24 
 
 		 549 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4527  putative phage-related protein  42.86 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>