39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2088 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2088  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  278  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.217793  normal  0.0481295 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1124  hypothetical protein  89.05 
 
 		 138 aa  257  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2927  hypothetical protein  47.52 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.30294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2778  hypothetical protein  47.1 
 
 		 139 aa  123  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2618  hypothetical protein  37.31 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000782229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2669  hypothetical protein  36.57 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2858  hypothetical protein  36.57 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.817778  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0897  LacI family regulatory protein  37.5 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.238169  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1942  putative bacteriophage-related protein  34.81 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1226  putative bacteriophage-related protein  33.59 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.856752  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3775  putative phage-related protein  35.43 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1936  putative phage-related protein  35.43 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.46577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2763  hypothetical protein  36.8 
 
 		 172 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498341 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1422  LacI family regulatory protein  34.45 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3231  hypothetical protein  35.54 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0892  putative phage-related protein  31.93 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  33.62 
 
 		 489 aa  67  0.00000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2273  hypothetical protein  35.2 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.647833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  31.9 
 
 		 500 aa  65.5  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3173  putative bacteriophage-related protein  32.52 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2633  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein, truncation  34.09 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2632  hypothetical protein  33.88 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2274  hypothetical protein  30.43 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4118  hypothetical protein  31.43 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3172  putative bacteriophage-related protein  34.12 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3248  putative bacteriophage-related protein  32.94 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.767846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1399  putative bacteriophage-related protein  34.52 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1950  putative phage-related protein  27.12 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  28.03 
 
 		 545 aa  50.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  31.76 
 
 		 532 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4527  putative phage-related protein  46.3 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2834  hypothetical protein  25.83 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2082  hypothetical protein  24.6 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0584139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  34.07 
 
 		 568 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  28.18 
 
 		 550 aa  47  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1580  hypothetical protein  26.12 
 
 		 303 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  30.59 
 
 		 506 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  29.89 
 
 		 549 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4308  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>