36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2763 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2763  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  351  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498341 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1422  LacI family regulatory protein  62.14 
 
 		 145 aa  182  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0892  putative phage-related protein  47.83 
 
 		 158 aa  131  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2669  hypothetical protein  41.13 
 
 		 137 aa  86.3  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1124  hypothetical protein  36.92 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0897  LacI family regulatory protein  38.21 
 
 		 139 aa  85.5  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.238169  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2088  hypothetical protein  36.8 
 
 		 137 aa  85.1  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.217793  normal  0.0481295 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2618  hypothetical protein  40.32 
 
 		 137 aa  84.7  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000782229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1226  putative bacteriophage-related protein  40.48 
 
 		 133 aa  84.7  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.856752  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2858  hypothetical protein  41.94 
 
 		 138 aa  84.3  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.817778  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1942  putative bacteriophage-related protein  39.32 
 
 		 136 aa  84.3  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2778  hypothetical protein  38.58 
 
 		 139 aa  84  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1936  putative phage-related protein  35.56 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.46577  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3775  putative phage-related protein  35.56 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2927  hypothetical protein  37.8 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.30294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4527  putative phage-related protein  62.75 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2632  hypothetical protein  35.94 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1950  putative phage-related protein  30.58 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  30.09 
 
 		 489 aa  58.2  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  28.57 
 
 		 500 aa  57  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2273  hypothetical protein  38.64 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.647833  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3172  putative bacteriophage-related protein  37.93 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2633  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein, truncation  36.36 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1399  putative bacteriophage-related protein  45.76 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3248  putative bacteriophage-related protein  36.78 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.767846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3173  putative bacteriophage-related protein  36.96 
 
 		 157 aa  51.6  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2082  hypothetical protein  27.87 
 
 		 127 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0584139 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3231  hypothetical protein  29.84 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2834  hypothetical protein  26.61 
 
 		 127 aa  48.1  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2274  hypothetical protein  30.16 
 
 		 123 aa  47.8  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  32.29 
 
 		 506 aa  45.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2796  hypothetical protein  37.35 
 
 		 131 aa  44.7  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  33.71 
 
 		 545 aa  42  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  30.19 
 
 		 549 aa  41.6  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4118  hypothetical protein  31.65 
 
 		 104 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2865  hypothetical protein  34.52 
 
 		 131 aa  42  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal  0.608797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>