30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4118 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4118  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  209  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  40.21 
 
 		 568 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1580  hypothetical protein  39.18 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3231  hypothetical protein  40.62 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1226  putative bacteriophage-related protein  40.91 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.856752  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0897  LacI family regulatory protein  33.71 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.238169  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1124  hypothetical protein  35.85 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2669  hypothetical protein  33.7 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2618  hypothetical protein  33.7 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000782229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2088  hypothetical protein  31.43 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.217793  normal  0.0481295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1942  putative bacteriophage-related protein  31.31 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1936  putative phage-related protein  32.99 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.46577  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3775  putative phage-related protein  32.99 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  31.46 
 
 		 500 aa  54.7  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2858  hypothetical protein  32.26 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.817778  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3248  putative bacteriophage-related protein  33.33 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.767846 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  31.46 
 
 		 489 aa  52.8  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2633  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein, truncation  35.42 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2927  hypothetical protein  30.3 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.30294  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3172  putative bacteriophage-related protein  31.25 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2778  hypothetical protein  31.11 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  33.85 
 
 		 545 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  30.39 
 
 		 550 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1950  putative phage-related protein  25.71 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2274  hypothetical protein  29.9 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1422  LacI family regulatory protein  36.99 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  36.84 
 
 		 522 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2763  hypothetical protein  31.65 
 
 		 172 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498341 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2834  hypothetical protein  27.08 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2082  hypothetical protein  26.8 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0584139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>