40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1124 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1124  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  280  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2088  hypothetical protein  89.05 
 
 
137 aa  257  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.217793  normal  0.0481295 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2927  hypothetical protein  46.1 
 
 
144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.30294  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2778  hypothetical protein  46.72 
 
 
139 aa  121  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2618  hypothetical protein  38.81 
 
 
137 aa  97.4  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000782229  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2669  hypothetical protein  38.06 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2858  hypothetical protein  36.69 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.817778  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0897  LacI family regulatory protein  39.39 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.238169  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1226  putative bacteriophage-related protein  35.88 
 
 
133 aa  88.6  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.856752  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3775  putative phage-related protein  36.43 
 
 
140 aa  87.8  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111218  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1936  putative phage-related protein  36.43 
 
 
140 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.46577  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1942  putative bacteriophage-related protein  34.11 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2763  hypothetical protein  36.92 
 
 
172 aa  85.9  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000498341 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1422  LacI family regulatory protein  33.61 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3231  hypothetical protein  34.71 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  35.54 
 
 
489 aa  72.4  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0892  putative phage-related protein  33.33 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  33.62 
 
 
500 aa  70.1  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2273  hypothetical protein  36 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.647833  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3173  putative bacteriophage-related protein  31.54 
 
 
157 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2633  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein, truncation  33.68 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2632  hypothetical protein  31.4 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4118  hypothetical protein  35.85 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3172  putative bacteriophage-related protein  34.15 
 
 
124 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1950  putative phage-related protein  27.97 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2274  hypothetical protein  28.7 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429487  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1399  putative bacteriophage-related protein  34.52 
 
 
93 aa  53.5  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3248  putative bacteriophage-related protein  32.93 
 
 
124 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.767846 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2834  hypothetical protein  27.27 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  28.36 
 
 
545 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2082  hypothetical protein  25.98 
 
 
127 aa  50.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0584139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  28.15 
 
 
568 aa  48.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4527  putative phage-related protein  44.44 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1580  hypothetical protein  25.93 
 
 
303 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  30.59 
 
 
532 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  31.76 
 
 
506 aa  47  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  27.27 
 
 
550 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  28.89 
 
 
549 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4308  hypothetical protein  35.71 
 
 
171 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  36.67 
 
 
285 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>