31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2632 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2632  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  300  7.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3173  putative bacteriophage-related protein  56.16 
 
 
157 aa  157  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2273  hypothetical protein  47.02 
 
 
158 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.647833  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1399  putative bacteriophage-related protein  49.4 
 
 
93 aa  75.9  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2927  hypothetical protein  32.56 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.30294  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2778  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1226  putative bacteriophage-related protein  37.61 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.856752  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1942  putative bacteriophage-related protein  34.13 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3775  putative phage-related protein  34.07 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111218  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1936  putative phage-related protein  34.07 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.46577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2763  hypothetical protein  35.94 
 
 
172 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000498341 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2669  hypothetical protein  36.17 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2618  hypothetical protein  36.17 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000782229  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2633  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein, truncation  48.39 
 
 
127 aa  60.5  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2858  hypothetical protein  36.17 
 
 
138 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.817778  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2088  hypothetical protein  33.88 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.217793  normal  0.0481295 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3248  putative bacteriophage-related protein  39.08 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.767846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3172  putative bacteriophage-related protein  40.23 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2274  hypothetical protein  36.89 
 
 
123 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429487  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1124  hypothetical protein  31.4 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0897  LacI family regulatory protein  33.33 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.238169  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0892  putative phage-related protein  31.82 
 
 
158 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1422  LacI family regulatory protein  30.83 
 
 
145 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  27.42 
 
 
500 aa  51.6  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  32.56 
 
 
489 aa  50.1  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2796  hypothetical protein  48.21 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197131  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3231  hypothetical protein  30 
 
 
154 aa  48.5  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2834  hypothetical protein  30.36 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1950  putative phage-related protein  33.33 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2082  hypothetical protein  31.15 
 
 
127 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0584139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2865  hypothetical protein  41.43 
 
 
131 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal  0.608797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>