35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1422 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1422  LacI family regulatory protein  100 
 
 
145 aa  290  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2763  hypothetical protein  62.14 
 
 
172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000498341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0892  putative phage-related protein  54.55 
 
 
158 aa  153  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0897  LacI family regulatory protein  40 
 
 
139 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.238169  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3775  putative phage-related protein  36.96 
 
 
140 aa  88.6  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111218  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1936  putative phage-related protein  36.96 
 
 
140 aa  88.6  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.46577  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1942  putative bacteriophage-related protein  40.68 
 
 
136 aa  86.7  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2778  hypothetical protein  38.81 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2927  hypothetical protein  36.84 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.30294  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2669  hypothetical protein  35.88 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1226  putative bacteriophage-related protein  37.12 
 
 
133 aa  84.3  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.856752  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2618  hypothetical protein  35.88 
 
 
137 aa  84.3  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000782229  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1124  hypothetical protein  33.61 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2858  hypothetical protein  35.38 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.817778  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2088  hypothetical protein  34.45 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.217793  normal  0.0481295 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4527  putative phage-related protein  67.27 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  26.72 
 
 
500 aa  56.2  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1950  putative phage-related protein  29.46 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3248  putative bacteriophage-related protein  37.35 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.767846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3172  putative bacteriophage-related protein  37.35 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  27.19 
 
 
489 aa  53.5  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2632  hypothetical protein  30.83 
 
 
154 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2633  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein, truncation  33.33 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2834  hypothetical protein  27.56 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2273  hypothetical protein  36.05 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.647833  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3231  hypothetical protein  28.24 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2082  hypothetical protein  27.34 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0584139 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2274  hypothetical protein  28.8 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429487  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4118  hypothetical protein  36.99 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1399  putative bacteriophage-related protein  41.18 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  31.37 
 
 
532 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  27.05 
 
 
545 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  32.5 
 
 
549 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4308  hypothetical protein  37.7 
 
 
171 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0595  hypothetical protein  34.88 
 
 
128 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>