37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2858 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2858  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  278  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.817778  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2669  hypothetical protein  93.43 
 
 		 137 aa  254  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2618  hypothetical protein  92.7 
 
 		 137 aa  253  8e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000782229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1226  putative bacteriophage-related protein  41.41 
 
 		 133 aa  107  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.856752  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2927  hypothetical protein  36.17 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.30294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2778  hypothetical protein  37.96 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1942  putative bacteriophage-related protein  38.76 
 
 		 136 aa  98.6  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1124  hypothetical protein  36.69 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2088  hypothetical protein  36.57 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.217793  normal  0.0481295 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0892  putative phage-related protein  37.6 
 
 		 158 aa  93.6  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0897  LacI family regulatory protein  36.43 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.238169  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3775  putative phage-related protein  34.88 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1936  putative phage-related protein  34.88 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.46577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2763  hypothetical protein  41.94 
 
 		 172 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498341 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1422  LacI family regulatory protein  35.38 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3231  hypothetical protein  37.12 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  36.28 
 
 		 500 aa  71.6  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  36.04 
 
 		 489 aa  70.9  0.000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2274  hypothetical protein  32.48 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1950  putative phage-related protein  29.51 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3248  putative bacteriophage-related protein  33.7 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.767846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3172  putative bacteriophage-related protein  40.28 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2633  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein, truncation  37.21 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1399  putative bacteriophage-related protein  42.05 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  30.6 
 
 		 532 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2632  hypothetical protein  36.17 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2273  hypothetical protein  31.2 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.647833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  28.35 
 
 		 545 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  32.11 
 
 		 549 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4118  hypothetical protein  32.26 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  31.82 
 
 		 550 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2834  hypothetical protein  28.16 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2082  hypothetical protein  23.39 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0584139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3173  putative bacteriophage-related protein  31.91 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  28.26 
 
 		 506 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4308  hypothetical protein  37.7 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  28.03 
 
 		 568 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>