34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3172 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3172  putative bacteriophage-related protein  100 
 
 		 124 aa  253  9e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3248  putative bacteriophage-related protein  93.44 
 
 		 124 aa  206  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.767846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2274  hypothetical protein  66.95 
 
 		 123 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2633  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein, truncation  64.8 
 
 		 127 aa  150  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1153  hypothetical protein  50.91 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1942  putative bacteriophage-related protein  41.13 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3231  hypothetical protein  33.86 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2858  hypothetical protein  37.11 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.817778  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1226  putative bacteriophage-related protein  34.71 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.856752  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2669  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2618  hypothetical protein  32.46 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000782229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2632  hypothetical protein  37.59 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1936  putative phage-related protein  31.71 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.46577  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3775  putative phage-related protein  31.71 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0897  LacI family regulatory protein  31.45 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.238169  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2088  hypothetical protein  32.17 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.217793  normal  0.0481295 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1124  hypothetical protein  31.3 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3173  putative bacteriophage-related protein  39.25 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2763  hypothetical protein  34.15 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498341 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1422  LacI family regulatory protein  31.97 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  26.61 
 
 		 489 aa  58.2  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2778  hypothetical protein  25.98 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2927  hypothetical protein  25.2 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.30294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  24.77 
 
 		 500 aa  55.1  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  31.58 
 
 		 545 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0892  putative phage-related protein  31.71 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1950  putative phage-related protein  28.04 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2082  hypothetical protein  29.41 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0584139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1399  putative bacteriophage-related protein  35.63 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4118  hypothetical protein  31.25 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2273  hypothetical protein  30.53 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.647833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  31.11 
 
 		 506 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  31.71 
 
 		 522 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2834  hypothetical protein  27.62 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>