More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3354 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3354  GTP cyclohydrolase  100 
 
 		 219 aa  438  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4850  GTP cyclohydrolase  69.27 
 
 		 218 aa  260  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2829  GTP cyclohydrolase I  61.78 
 
 		 220 aa  228  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0351357  normal  0.452296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2639  GTP cyclohydrolase I  63.98 
 
 		 211 aa  221  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0530307  normal  0.512289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3643  GTP cyclohydrolase I  65.78 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0117786  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1665  GTP cyclohydrolase  58.47 
 
 		 212 aa  204  6e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.109192 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24770  GTP cyclohydrolase I  55.43 
 
 		 195 aa  187  8e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  54.35 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  56.08 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2986  GTP cyclohydrolase I  55.15 
 
 		 202 aa  185  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.472949  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  53.8 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0315  GTP cyclohydrolase I  52.13 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  57.14 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  53.93 
 
 		 205 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  52.43 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0836  GTP cyclohydrolase I  48.82 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0812961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  52.33 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  49.45 
 
 		 188 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  54.49 
 
 		 202 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  54.05 
 
 		 219 aa  178  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  52.6 
 
 		 206 aa  177  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0539  GTP cyclohydrolase I  55.87 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  53.26 
 
 		 206 aa  177  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  50.27 
 
 		 214 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  52.17 
 
 		 190 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2184  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0182088 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3872  GTP cyclohydrolase I  49.18 
 
 		 229 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0628  GTP cyclohydrolase I  55.31 
 
 		 216 aa  175  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00907576  normal  0.596235 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  53.97 
 
 		 222 aa  175  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  52.41 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  52.41 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  52.41 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  46.24 
 
 		 189 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  45.99 
 
 		 189 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  50.81 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  51.61 
 
 		 202 aa  172  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  50.8 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 		 193 aa  171  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  49.47 
 
 		 194 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  45.7 
 
 		 189 aa  171  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  51.18 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3248  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182392  normal  0.472848 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  50.52 
 
 		 199 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5183  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58549  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  50.52 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  50.8 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  46.11 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  47.57 
 
 		 188 aa  168  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0356  GTP cyclohydrolase I  49.17 
 
 		 213 aa  168  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0218515 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  45.5 
 
 		 227 aa  168  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  48.84 
 
 		 188 aa  168  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  43.72 
 
 		 201 aa  168  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  47.75 
 
 		 258 aa  168  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0018  GTP cyclohydrolase I  47.34 
 
 		 182 aa  168  7e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00365351  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  46.11 
 
 		 213 aa  167  9e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  49.75 
 
 		 210 aa  167  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  47.19 
 
 		 292 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  47.19 
 
 		 292 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1329  GTP cyclohydrolase I  48.35 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  47.19 
 
 		 292 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  47.19 
 
 		 292 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  47.59 
 
 		 188 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  47.19 
 
 		 292 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  49.75 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  44.9 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  46.63 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  47.19 
 
 		 242 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  47.19 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1657  GTP cyclohydrolase I  48.33 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1576  GTP cyclohydrolase I  43.15 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.0635518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  44.9 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  52.78 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  46.7 
 
 		 242 aa  165  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3114  GTP cyclohydrolase I  48.33 
 
 		 234 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  46.03 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  44.39 
 
 		 222 aa  165  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  45.05 
 
 		 269 aa  165  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  45.05 
 
 		 269 aa  165  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  46.11 
 
 		 272 aa  165  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  46.45 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 190 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  46.45 
 
 		 212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  44.13 
 
 		 206 aa  164  9e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  46.81 
 
 		 189 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  47.75 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  43.59 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20920  GTP cyclohydrolase I  48.66 
 
 		 195 aa  164  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  47.75 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  48.65 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  46.7 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2203  GTP cyclohydrolase I  44.26 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128412  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  44.56 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  44.56 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  44.56 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  44.44 
 
 		 203 aa  162  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2153  GTP cyclohydrolase I  48.39 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314147  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2222  GTP cyclohydrolase I  44.51 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0899114 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  49.19 
 
 		 189 aa  162  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  45.74 
 
 		 189 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  45.74 
 
 		 189 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000600048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>