More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0018 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0018  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 182 aa  372  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00365351  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  63.89 
 
 		 187 aa  249  2e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  54.26 
 
 		 198 aa  210  7.999999999999999e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  54.59 
 
 		 188 aa  209  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1274  GTP cyclohydrolase I  55.68 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000261815  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  56.22 
 
 		 188 aa  207  9e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1096  GTP cyclohydrolase I  55.14 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  55.61 
 
 		 189 aa  205  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  54.35 
 
 		 190 aa  204  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  53.72 
 
 		 192 aa  204  5e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  52.97 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  55.08 
 
 		 188 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2203  GTP cyclohydrolase I  54.05 
 
 		 187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  54.55 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0977  GTP cyclohydrolase I  50.79 
 
 		 207 aa  193  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  49.46 
 
 		 247 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  54.3 
 
 		 187 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  51.34 
 
 		 188 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  51.63 
 
 		 186 aa  191  7e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  49.2 
 
 		 189 aa  190  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  53.93 
 
 		 195 aa  190  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2153  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 188 aa  189  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314147  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  48.92 
 
 		 189 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1421  GTP cyclohydrolase I  48.92 
 
 		 189 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0305505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1393  GTP cyclohydrolase I  48.92 
 
 		 189 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000458724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  48.92 
 
 		 189 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  48.92 
 
 		 189 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  48.92 
 
 		 189 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  48.92 
 
 		 189 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000600048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  48.92 
 
 		 189 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  48.92 
 
 		 189 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1567  GTP cyclohydrolase I  48.92 
 
 		 189 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  49.46 
 
 		 239 aa  188  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  49.46 
 
 		 239 aa  188  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  48.94 
 
 		 187 aa  187  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  51.89 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24880  GTP cyclohydrolase I  51.61 
 
 		 194 aa  185  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  48.39 
 
 		 235 aa  185  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20920  GTP cyclohydrolase I  53.51 
 
 		 195 aa  184  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2817  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 206 aa  184  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  51.61 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  52.97 
 
 		 210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  52.81 
 
 		 223 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4315  GTP cyclohydrolase  51.89 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 		 190 aa  182  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  48.91 
 
 		 235 aa  181  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  51.38 
 
 		 218 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 190 aa  181  6e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  49.45 
 
 		 219 aa  181  7e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  45.45 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  47.06 
 
 		 213 aa  179  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  47.03 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3643  GTP cyclohydrolase I  50.93 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0117786  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  52.75 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  49.46 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  49.46 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  50.28 
 
 		 216 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  47.06 
 
 		 218 aa  178  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  49.74 
 
 		 226 aa  178  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2639  GTP cyclohydrolase I  48.8 
 
 		 211 aa  178  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0530307  normal  0.512289 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  49.18 
 
 		 190 aa  177  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  48.4 
 
 		 189 aa  177  7e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  47.09 
 
 		 222 aa  177  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 		 194 aa  177  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  47.87 
 
 		 189 aa  176  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  47.57 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  46.77 
 
 		 198 aa  176  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  47.87 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  46.77 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  50.28 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  46.33 
 
 		 190 aa  175  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  46.49 
 
 		 202 aa  175  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4064  GTP cyclohydrolase I  45.3 
 
 		 197 aa  175  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.999809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 190 aa  175  3e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  49.46 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4850  GTP cyclohydrolase  48.52 
 
 		 218 aa  175  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  53.76 
 
 		 201 aa  174  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  47.83 
 
 		 223 aa  174  8e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  53.14 
 
 		 199 aa  174  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0624  GTP cyclohydrolase I  49.19 
 
 		 195 aa  174  9e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  49.72 
 
 		 270 aa  173  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  45.95 
 
 		 214 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  45.95 
 
 		 214 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  44.62 
 
 		 219 aa  173  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0628  GTP cyclohydrolase I  48.09 
 
 		 216 aa  173  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00907576  normal  0.596235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  45.95 
 
 		 202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  46.77 
 
 		 193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  51.41 
 
 		 210 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  44.39 
 
 		 212 aa  172  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  47.31 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2829  GTP cyclohydrolase I  43.26 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0351357  normal  0.452296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2007  GTP cyclohydrolase  44.75 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.39333  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3635  GTP cyclohydrolase  47.46 
 
 		 192 aa  171  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  44.89 
 
 		 272 aa  171  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  45.45 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  46.49 
 
 		 243 aa  171  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  45.51 
 
 		 269 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  45.51 
 
 		 269 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>