More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2829 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2829  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 220 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0351357  normal  0.452296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2639  GTP cyclohydrolase I  64.53 
 
 		 211 aa  248  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0530307  normal  0.512289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3643  GTP cyclohydrolase I  70.05 
 
 		 226 aa  248  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0117786  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4850  GTP cyclohydrolase  63.64 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3354  GTP cyclohydrolase  61.78 
 
 		 219 aa  228  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1665  GTP cyclohydrolase  61.38 
 
 		 212 aa  224  7e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.109192 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  57.61 
 
 		 200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  55.79 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  52.63 
 
 		 219 aa  193  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  55.14 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  54.79 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0836  GTP cyclohydrolase I  53.44 
 
 		 214 aa  187  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0812961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  55.91 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  53.44 
 
 		 206 aa  187  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24770  GTP cyclohydrolase I  56.42 
 
 		 195 aa  184  6e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  47.87 
 
 		 235 aa  184  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  48.47 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  48.47 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  54.3 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  54.3 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  54.3 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  51.89 
 
 		 193 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  53.07 
 
 		 190 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  48.39 
 
 		 213 aa  181  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  55 
 
 		 202 aa  181  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0628  GTP cyclohydrolase I  54.89 
 
 		 216 aa  181  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00907576  normal  0.596235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  53.23 
 
 		 202 aa  181  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  52.72 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  47.34 
 
 		 247 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2986  GTP cyclohydrolase I  54.59 
 
 		 202 aa  180  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.472949  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  50.57 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  48.62 
 
 		 187 aa  178  7e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  51.81 
 
 		 219 aa  177  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  48.15 
 
 		 203 aa  177  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  53.26 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  45.86 
 
 		 187 aa  176  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  45.21 
 
 		 235 aa  176  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  51.37 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  52.72 
 
 		 222 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  52.15 
 
 		 202 aa  175  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  50.81 
 
 		 216 aa  174  8e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  48.45 
 
 		 226 aa  174  9e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  52.17 
 
 		 234 aa  174  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  51.09 
 
 		 210 aa  174  9e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  47.06 
 
 		 188 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0539  GTP cyclohydrolase I  52.02 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  50.28 
 
 		 194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  46.74 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0315  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  51.41 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0018  GTP cyclohydrolase I  43.26 
 
 		 182 aa  172  3.9999999999999995e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00365351  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  47.87 
 
 		 192 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  43.85 
 
 		 206 aa  171  5e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  50.29 
 
 		 212 aa  172  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  48.02 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03535  GTP cyclohydrolase I  48.09 
 
 		 190 aa  171  5.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12810  GTP cyclohydrolase I  52.72 
 
 		 188 aa  171  5.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  44.97 
 
 		 189 aa  171  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  52.17 
 
 		 200 aa  171  9e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  45.41 
 
 		 189 aa  170  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  46.74 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  49.44 
 
 		 216 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  46.81 
 
 		 189 aa  170  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  48.65 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  46.86 
 
 		 243 aa  170  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  45.41 
 
 		 189 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  47.46 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  48.09 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  47.85 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  50.83 
 
 		 190 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  46.81 
 
 		 189 aa  169  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  45.36 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  50.85 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  46.96 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  47.62 
 
 		 188 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  46.96 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 		 257 aa  168  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  46.67 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  46.28 
 
 		 189 aa  168  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  46.28 
 
 		 189 aa  168  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  46.28 
 
 		 189 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000600048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1421  GTP cyclohydrolase I  46.28 
 
 		 189 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0305505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1393  GTP cyclohydrolase I  46.28 
 
 		 189 aa  168  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000458724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  46.28 
 
 		 189 aa  168  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1567  GTP cyclohydrolase I  46.28 
 
 		 189 aa  168  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  46.28 
 
 		 189 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3248  GTP cyclohydrolase I  46.99 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182392  normal  0.472848 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  46.28 
 
 		 189 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2184  GTP cyclohydrolase I  46.99 
 
 		 229 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0182088 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  49.18 
 
 		 218 aa  167  9e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  48.57 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1329  GTP cyclohydrolase I  41.07 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  48.57 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  46.63 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3872  GTP cyclohydrolase I  45.9 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  45.2 
 
 		 190 aa  166  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  43.35 
 
 		 242 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  47.28 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  43.35 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>