More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2639 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2639  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0530307  normal  0.512289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2829  GTP cyclohydrolase I  66.49 
 
 		 220 aa  256  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0351357  normal  0.452296 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3643  GTP cyclohydrolase I  72.87 
 
 		 226 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0117786  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1665  GTP cyclohydrolase  63.9 
 
 		 212 aa  244  6e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.109192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3354  GTP cyclohydrolase  63.98 
 
 		 219 aa  231  5e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4850  GTP cyclohydrolase  64.17 
 
 		 218 aa  226  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  53.44 
 
 		 219 aa  194  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  54.7 
 
 		 190 aa  192  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  54.01 
 
 		 219 aa  191  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  48.95 
 
 		 192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0836  GTP cyclohydrolase I  51.6 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0812961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  50.24 
 
 		 205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  51.61 
 
 		 206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  48.35 
 
 		 188 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0018  GTP cyclohydrolase I  48.8 
 
 		 182 aa  179  4e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00365351  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  47.22 
 
 		 187 aa  179  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  48.9 
 
 		 227 aa  178  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  47.06 
 
 		 188 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  50.55 
 
 		 202 aa  177  9e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  50.56 
 
 		 190 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  50.56 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  50.78 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  51.37 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  51.61 
 
 		 202 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  48.96 
 
 		 200 aa  175  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 198 aa  174  7e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  48.92 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  47.18 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  47.18 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  50.79 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  47.75 
 
 		 225 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  52.17 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  47.31 
 
 		 213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  51.37 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  50.52 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  50.79 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 		 188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  52.17 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  46.07 
 
 		 203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 193 aa  171  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  48.11 
 
 		 234 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  47.09 
 
 		 235 aa  171  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24880  GTP cyclohydrolase I  50.82 
 
 		 194 aa  171  9e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  47.51 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  48.9 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  46.67 
 
 		 209 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  46.99 
 
 		 189 aa  170  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  51.12 
 
 		 270 aa  169  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  48.91 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  46.67 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12810  GTP cyclohydrolase I  52.17 
 
 		 188 aa  170  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  44.56 
 
 		 212 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  48.63 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  46.45 
 
 		 189 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  52.2 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20920  GTP cyclohydrolase I  49.48 
 
 		 195 aa  169  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  47.22 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  46.15 
 
 		 189 aa  168  7e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 		 219 aa  168  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  46.67 
 
 		 258 aa  168  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0539  GTP cyclohydrolase I  49.75 
 
 		 205 aa  167  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2986  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 		 202 aa  167  9e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.472949  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  45.03 
 
 		 203 aa  167  9e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  45.3 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  49.47 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  48.9 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  48.57 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  45.95 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  46.11 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  41.01 
 
 		 272 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  51.98 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  47.31 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  46.7 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  46.11 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03535  GTP cyclohydrolase I  48.35 
 
 		 190 aa  166  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  46.96 
 
 		 235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  45.56 
 
 		 242 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  46.67 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  46.67 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  46.67 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  46.67 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1171  GTP cyclohydrolase  49.72 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.121032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  45.56 
 
 		 236 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  46.67 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  46.93 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  46.07 
 
 		 292 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  49.21 
 
 		 200 aa  164  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  45.76 
 
 		 226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  46.07 
 
 		 292 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  46.07 
 
 		 292 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0628  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 216 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00907576  normal  0.596235 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  46.07 
 
 		 292 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  46.07 
 
 		 292 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  45.9 
 
 		 187 aa  164  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  49.44 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  46.24 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  46.24 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  46.24 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  46.24 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>