150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1349 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1349  respiratory nitrate reductase gamma subunit  100 
 
 
242 aa  488  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5444  Nitrate reductase  65.15 
 
 
242 aa  322  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2806  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  59 
 
 
248 aa  298  5e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.460402  normal  0.0323748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0903  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  60.42 
 
 
243 aa  293  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3141  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  61.34 
 
 
253 aa  292  4e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.172601  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11754  nitrate reductase narX  60.76 
 
 
652 aa  291  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0308508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3672  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  60.25 
 
 
243 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167763  normal  0.110852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4543  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  61.18 
 
 
243 aa  287  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.290259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2159  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  59.92 
 
 
243 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817555 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1827  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  55.65 
 
 
246 aa  284  7e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.259695  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1286  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  59.49 
 
 
243 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.65257  normal  0.0385137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1260  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  59.07 
 
 
243 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259966  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1277  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  59.07 
 
 
243 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18690  respiratory nitrate reductase gamma subunit  56.9 
 
 
243 aa  278  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.073165  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3702  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  57.74 
 
 
248 aa  273  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0317  respiratory nitrate reductase gamma subunit  55.46 
 
 
260 aa  263  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0180  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  53.91 
 
 
247 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363972  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1760  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  56.85 
 
 
251 aa  259  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1921  Nitrate reductase  56.3 
 
 
240 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4426  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  56.97 
 
 
250 aa  258  8e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.325203  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4475  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  51.05 
 
 
241 aa  251  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.323862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5210  respiratory nitrate reductase subunit gamma  54.77 
 
 
244 aa  249  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11189  respiratory nitrate reductase gamma subunit narI  53.59 
 
 
246 aa  248  8e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0195  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  57.01 
 
 
247 aa  241  6e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.026405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2037  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  53.39 
 
 
233 aa  235  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1238  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  51.57 
 
 
238 aa  229  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.361113 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1980  respiratory nitrate reductase subunit gamma  45.54 
 
 
229 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.689777  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1935  nitrate reductase, gamma subunit  45.98 
 
 
229 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.840407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2161  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  45.98 
 
 
229 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2128  respiratory nitrate reductase subunit gamma  45.54 
 
 
229 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.833335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1974  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  45.98 
 
 
229 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1957  nitrate reductase, gamma subunit  45.54 
 
 
228 aa  222  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0223608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2278  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  45.54 
 
 
229 aa  222  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.339538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2138  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  44 
 
 
229 aa  221  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3402  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.43 
 
 
229 aa  221  6e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3177  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  45.09 
 
 
229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1488  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  50.23 
 
 
585 aa  216  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1528  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.58 
 
 
234 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000209931  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  48.21 
 
 
234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  45.33 
 
 
225 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2466  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  45.33 
 
 
225 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1984  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  42.22 
 
 
225 aa  211  5.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1208  respiratory nitrate reductase gamma subunit  46.12 
 
 
260 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.787753  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0506  respiratory nitrate reductase gamma subunit  45.74 
 
 
250 aa  201  6e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.273339 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  38.6 
 
 
233 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0298613  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2125  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  38.29 
 
 
254 aa  138  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2256  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  38.22 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0442548  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2589  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  37.84 
 
 
255 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2561  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  38.22 
 
 
229 aa  132  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.40821  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5386  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36.12 
 
 
227 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.338397  normal  0.0191932 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1774  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36.44 
 
 
225 aa  131  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079326  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0296  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36.84 
 
 
241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2880  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.4 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2894  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  37.39 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104655  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.34 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  37.62 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1856  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.11 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0272  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36.4 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5005  respiratory nitrate reductase gamma subunit  36.12 
 
 
227 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144628  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1406  respiratory nitrate reductase gamma subunit  34.67 
 
 
232 aa  125  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1584  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.44 
 
 
238 aa  125  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000863008  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2517  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.36 
 
 
227 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189452  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2703  respiratory nitrate reductase gamma subunit  37.12 
 
 
234 aa  125  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304029  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2312  respiratory nitrate reductase gamma subunit  35.11 
 
 
225 aa  125  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1851  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36.12 
 
 
228 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1734  nitrate reductase, gamma subunit  35.68 
 
 
228 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2761  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.68 
 
 
228 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0941659  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2244  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.68 
 
 
228 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0745666  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3074  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.68 
 
 
228 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.523041  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2684  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.68 
 
 
228 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1517  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.68 
 
 
228 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.133049  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6187  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.07 
 
 
242 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0410952  hitchhiker  0.00730194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2632  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.32 
 
 
230 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2628  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.24 
 
 
228 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591566  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0977  respiratory nitrate reductase transmembrane protein  34.91 
 
 
227 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01423  nitrate reductase 2 (NRZ), gamma subunit  33.78 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2182  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.78 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.292963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2075  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  33.78 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2065  respiratory nitrate reductase gamma subunit  36.73 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1379  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.51 
 
 
225 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.477496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1549  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.78 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1646  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.78 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1957  nitrate reductase  34.05 
 
 
225 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2191  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.78 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01435  hypothetical protein  33.78 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0778  nitrate reductase gamma subunit  33.04 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.379399  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1897  respiratory nitrate reductase subunit gamma  34.51 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.017842  normal  0.804398 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1333  respiratory nitrate reductase gamma subunit  35.06 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1956  respiratory nitrate reductase subunit gamma  34.51 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817539  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1562  respiratory nitrate reductase gamma subunit  34.51 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.995386 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1892  respiratory nitrate reductase subunit gamma  34.51 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.644939  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2077  respiratory nitrate reductase subunit gamma  35.71 
 
 
227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0152156  normal  0.186259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2305  respiratory nitrate reductase gamma subunit  31.47 
 
 
227 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.369875  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3445  nitrate reductase, gamma subunit  36.07 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1711  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  34.96 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.163334  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1695  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  32.46 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.953876 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2396  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.96 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178622 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1912  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  34.96 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0870039  normal  0.196031 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1395  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  34.96 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1581  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  32.46 
 
 
226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.214627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>