151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3702 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3702  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  100 
 
 
248 aa  489  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0317  respiratory nitrate reductase gamma subunit  65.59 
 
 
260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2159  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  68.07 
 
 
243 aa  324  9e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4543  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  66.39 
 
 
243 aa  318  5e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.290259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0903  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  65.55 
 
 
243 aa  313  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3672  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  65.97 
 
 
243 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167763  normal  0.110852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1286  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  64.29 
 
 
243 aa  311  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.65257  normal  0.0385137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1260  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  63.87 
 
 
243 aa  310  9e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259966  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1277  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  63.87 
 
 
243 aa  310  9e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1921  Nitrate reductase  65.82 
 
 
240 aa  308  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5444  Nitrate reductase  64.58 
 
 
242 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11754  nitrate reductase narX  62.61 
 
 
652 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0308508 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4426  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  62.7 
 
 
250 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.325203  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5210  respiratory nitrate reductase subunit gamma  65.98 
 
 
244 aa  296  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2806  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  58.94 
 
 
248 aa  292  4e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.460402  normal  0.0323748 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1827  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  59.24 
 
 
246 aa  289  4e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.259695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3141  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  56.05 
 
 
253 aa  275  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.172601  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11189  respiratory nitrate reductase gamma subunit narI  57.14 
 
 
246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1349  respiratory nitrate reductase gamma subunit  57.74 
 
 
242 aa  273  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4475  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  54.51 
 
 
241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.323862 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1760  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  57.26 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18690  respiratory nitrate reductase gamma subunit  51.45 
 
 
243 aa  248  5e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.073165  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1935  nitrate reductase, gamma subunit  47.6 
 
 
229 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.840407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1974  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.6 
 
 
229 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3177  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.12 
 
 
229 aa  225  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2278  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.53 
 
 
229 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.339538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1980  respiratory nitrate reductase subunit gamma  45.69 
 
 
229 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.689777  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1957  nitrate reductase, gamma subunit  46.29 
 
 
228 aa  225  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0223608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2128  respiratory nitrate reductase subunit gamma  45.69 
 
 
229 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.833335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2161  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  45.69 
 
 
229 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2138  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.16 
 
 
229 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0180  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.61 
 
 
247 aa  218  7e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363972  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3402  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  45.74 
 
 
229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2037  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.27 
 
 
233 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1528  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  43.95 
 
 
234 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000209931  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0506  respiratory nitrate reductase gamma subunit  44.35 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.273339 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  45.26 
 
 
234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1238  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  45.18 
 
 
238 aa  198  7.999999999999999e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.361113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0195  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.36 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.026405 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1488  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.06 
 
 
585 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  42.86 
 
 
225 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2466  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  42.86 
 
 
225 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1984  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  41.52 
 
 
225 aa  187  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1208  respiratory nitrate reductase gamma subunit  38.6 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.787753  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0778  nitrate reductase gamma subunit  37.04 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.379399  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.92 
 
 
233 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0298613  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2632  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.74 
 
 
230 aa  123  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2125  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.54 
 
 
254 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3445  nitrate reductase, gamma subunit  36.57 
 
 
225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6187  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.56 
 
 
242 aa  118  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0410952  hitchhiker  0.00730194 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3083  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.6 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.49935  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5386  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.02 
 
 
227 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.338397  normal  0.0191932 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03844  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.84 
 
 
227 aa  115  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1584  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.3 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000863008  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2703  respiratory nitrate reductase gamma subunit  33.91 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304029  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2589  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.09 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13830  respiratory nitrate reductase gamma chain  33.63 
 
 
227 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.792747  normal  0.19596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.96 
 
 
254 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5005  respiratory nitrate reductase gamma subunit  34.96 
 
 
227 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144628  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2795  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.74 
 
 
244 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2517  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.98 
 
 
227 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189452  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1333  respiratory nitrate reductase gamma subunit  32.75 
 
 
225 aa  112  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.03 
 
 
233 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1237  respiratory nitrate reductase gamma chain  33.19 
 
 
227 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0296  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.95 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4592  respiratory nitrate reductase gamma subunit  34.53 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0669  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0113371  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.6 
 
 
235 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0272  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.95 
 
 
241 aa  109  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5708  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.78 
 
 
227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6461  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.78 
 
 
227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153995  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0608  respiratory nitrate reductase gamma subunit  31 
 
 
241 aa  109  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2894  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.88 
 
 
240 aa  108  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104655  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1695  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  32.47 
 
 
226 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.953876 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1762  respiratory nitrate reductase 2 gamma subunit  32.03 
 
 
226 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01423  nitrate reductase 2 (NRZ), gamma subunit  32.46 
 
 
226 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2182  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.46 
 
 
226 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.292963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1549  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.46 
 
 
226 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1646  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.46 
 
 
226 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2191  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.46 
 
 
226 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01435  hypothetical protein  32.46 
 
 
226 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2075  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  32.46 
 
 
226 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1581  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  32.03 
 
 
226 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.214627  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1697  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  32.03 
 
 
226 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1957  nitrate reductase  30.4 
 
 
225 aa  106  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0332  respiratory nitrate reductase gamma subunit  29.91 
 
 
231 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000138371 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1851  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.19 
 
 
228 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1774  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.8 
 
 
225 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079326  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1758  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  31.6 
 
 
226 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351215  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0206  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.02 
 
 
222 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2065  respiratory nitrate reductase gamma subunit  31.72 
 
 
226 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1406  respiratory nitrate reductase gamma subunit  34.8 
 
 
232 aa  102  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1252  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.3 
 
 
227 aa  102  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3758  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31 
 
 
264 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1734  nitrate reductase, gamma subunit  32.74 
 
 
228 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2761  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.74 
 
 
228 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0941659  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2244  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.74 
 
 
228 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0745666  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3074  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.74 
 
 
228 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.523041  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2684  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.74 
 
 
228 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1517  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.74 
 
 
228 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.133049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>