151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1760 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1760  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  100 
 
 
251 aa  498  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2806  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  66.4 
 
 
248 aa  322  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.460402  normal  0.0323748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5444  Nitrate reductase  63.33 
 
 
242 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1827  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  62.61 
 
 
246 aa  296  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.259695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3141  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  58.92 
 
 
253 aa  296  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.172601  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1349  respiratory nitrate reductase gamma subunit  56.85 
 
 
242 aa  275  7e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4475  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  55.88 
 
 
241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.323862 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3702  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  57.26 
 
 
248 aa  272  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1286  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  56.72 
 
 
243 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.65257  normal  0.0385137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1260  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  56.3 
 
 
243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259966  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1277  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  56.3 
 
 
243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18690  respiratory nitrate reductase gamma subunit  56.79 
 
 
243 aa  266  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.073165  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2159  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  55.88 
 
 
243 aa  266  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817555 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3672  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  56.72 
 
 
243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167763  normal  0.110852 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0903  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  57.14 
 
 
243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4543  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  54.2 
 
 
243 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.290259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1921  Nitrate reductase  53.33 
 
 
240 aa  262  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11754  nitrate reductase narX  56.56 
 
 
652 aa  258  8e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0308508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11189  respiratory nitrate reductase gamma subunit narI  55.46 
 
 
246 aa  251  7e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0317  respiratory nitrate reductase gamma subunit  53.78 
 
 
260 aa  250  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0180  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  54.09 
 
 
247 aa  248  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363972  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2037  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  55.5 
 
 
233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4426  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  53.09 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.325203  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5210  respiratory nitrate reductase subunit gamma  53.28 
 
 
244 aa  229  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0195  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  52.07 
 
 
247 aa  228  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.026405 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1238  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  49.77 
 
 
238 aa  224  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.361113 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1974  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.15 
 
 
229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2278  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  44.89 
 
 
229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.339538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1980  respiratory nitrate reductase subunit gamma  45.7 
 
 
229 aa  218  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.689777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2128  respiratory nitrate reductase subunit gamma  45.7 
 
 
229 aa  218  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.833335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2161  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  45.7 
 
 
229 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2138  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  45.7 
 
 
229 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1957  nitrate reductase, gamma subunit  45.25 
 
 
228 aa  217  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0223608  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1984  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  45.5 
 
 
225 aa  216  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1935  nitrate reductase, gamma subunit  45.25 
 
 
229 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.840407  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0506  respiratory nitrate reductase gamma subunit  47.09 
 
 
250 aa  216  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.273339 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3177  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  45.25 
 
 
229 aa  214  9e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3402  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  44.34 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1488  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  51.15 
 
 
585 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1208  respiratory nitrate reductase gamma subunit  46.98 
 
 
260 aa  210  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.787753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1528  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.51 
 
 
234 aa  208  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000209931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  44.39 
 
 
225 aa  208  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2466  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  44.39 
 
 
225 aa  208  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  48.42 
 
 
234 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6187  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  37.12 
 
 
242 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0410952  hitchhiker  0.00730194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2632  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.65 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36 
 
 
233 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1406  respiratory nitrate reductase gamma subunit  37.5 
 
 
232 aa  123  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0778  nitrate reductase gamma subunit  34.88 
 
 
225 aa  123  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.379399  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1333  respiratory nitrate reductase gamma subunit  33.19 
 
 
225 aa  122  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0296  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.67 
 
 
241 aa  119  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0247  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  38.77 
 
 
248 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.373624  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3445  nitrate reductase, gamma subunit  33.49 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0272  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.25 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2894  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.67 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2125  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36.07 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2703  respiratory nitrate reductase gamma subunit  35.65 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304029  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.18 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0298613  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4592  respiratory nitrate reductase gamma subunit  32.91 
 
 
239 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5386  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.33 
 
 
227 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.338397  normal  0.0191932 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2256  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.93 
 
 
234 aa  115  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0442548  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2795  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.78 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3758  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.78 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2561  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.35 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.40821  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0119  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  37.17 
 
 
227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1627  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  37.17 
 
 
227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.474726  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1542  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  37.17 
 
 
227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1856  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.19 
 
 
225 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1252  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.84 
 
 
227 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.55 
 
 
235 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2589  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.39 
 
 
255 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.8 
 
 
254 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2312  respiratory nitrate reductase gamma subunit  34.42 
 
 
225 aa  113  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2305  respiratory nitrate reductase gamma subunit  33.02 
 
 
227 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.369875  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1584  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.62 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000863008  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1897  respiratory nitrate reductase subunit gamma  34.86 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.017842  normal  0.804398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1956  respiratory nitrate reductase subunit gamma  34.86 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817539  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2880  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.02 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1892  respiratory nitrate reductase subunit gamma  34.86 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.644939  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1562  respiratory nitrate reductase gamma subunit  34.86 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.995386 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5708  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.4 
 
 
227 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6461  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.4 
 
 
227 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153995  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1379  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.86 
 
 
225 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.477496  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2229  respiratory nitrate reductase gamma subunit  31.72 
 
 
227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125271  normal  0.0229196 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1705  respiratory nitrate reductase gamma subunit  33.04 
 
 
239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.06964  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1774  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.09 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079326  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1957  nitrate reductase  33.19 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2517  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.57 
 
 
227 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189452  normal  0.673257 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01423  nitrate reductase 2 (NRZ), gamma subunit  34.58 
 
 
226 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2182  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.58 
 
 
226 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.292963  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01435  hypothetical protein  34.58 
 
 
226 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1549  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.58 
 
 
226 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1646  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.58 
 
 
226 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2075  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  34.58 
 
 
226 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2191  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.58 
 
 
226 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01205  nitrate reductase 1, gamma (cytochrome b(NR)) subunit  33.02 
 
 
225 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.372615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01215  hypothetical protein  33.02 
 
 
225 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.316454  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1378  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.02 
 
 
225 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653452  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2396  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.02 
 
 
225 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178622 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1912  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  33.02 
 
 
225 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0870039  normal  0.196031 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>