150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1208 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1208  respiratory nitrate reductase gamma subunit  100 
 
 
260 aa  513  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.787753  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1984  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.05 
 
 
225 aa  234  8e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3402  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.52 
 
 
229 aa  230  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2138  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.35 
 
 
229 aa  229  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1974  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.35 
 
 
229 aa  228  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2161  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.78 
 
 
229 aa  228  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1980  respiratory nitrate reductase subunit gamma  46.35 
 
 
229 aa  228  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.689777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2128  respiratory nitrate reductase subunit gamma  46.35 
 
 
229 aa  228  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.833335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2278  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  45.92 
 
 
229 aa  228  9e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.339538  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1957  nitrate reductase, gamma subunit  46.75 
 
 
228 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0223608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1935  nitrate reductase, gamma subunit  45.92 
 
 
229 aa  226  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.840407  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  49.79 
 
 
234 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3177  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  45.92 
 
 
229 aa  225  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1528  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.19 
 
 
234 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000209931  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0180  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.03 
 
 
247 aa  221  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363972  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  45.61 
 
 
225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2466  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  45.61 
 
 
225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2037  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  48.21 
 
 
233 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1349  respiratory nitrate reductase gamma subunit  45.57 
 
 
242 aa  209  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1238  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  41.8 
 
 
238 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.361113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3141  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  42.08 
 
 
253 aa  206  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.172601  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0195  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  48.21 
 
 
247 aa  199  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.026405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4475  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  42.32 
 
 
241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.323862 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1827  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  45.19 
 
 
246 aa  199  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.259695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2806  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  44.08 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.460402  normal  0.0323748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5444  Nitrate reductase  43.27 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18690  respiratory nitrate reductase gamma subunit  41.22 
 
 
243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.073165  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1760  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.44 
 
 
251 aa  196  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2159  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  45.26 
 
 
243 aa  195  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4543  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  44.4 
 
 
243 aa  192  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.290259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1260  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  42.67 
 
 
243 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259966  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1277  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  42.67 
 
 
243 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1286  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  42.67 
 
 
243 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.65257  normal  0.0385137 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0506  respiratory nitrate reductase gamma subunit  41.56 
 
 
250 aa  188  9e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.273339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1488  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.22 
 
 
585 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1921  Nitrate reductase  41.81 
 
 
240 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11754  nitrate reductase narX  40.42 
 
 
652 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0308508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11189  respiratory nitrate reductase gamma subunit narI  41.41 
 
 
246 aa  172  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0903  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  38.43 
 
 
243 aa  171  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3702  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  37.4 
 
 
248 aa  169  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4426  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  44.4 
 
 
250 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.325203  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3672  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  37.6 
 
 
243 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167763  normal  0.110852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0317  respiratory nitrate reductase gamma subunit  41.81 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5210  respiratory nitrate reductase subunit gamma  40 
 
 
244 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  37.5 
 
 
233 aa  142  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6187  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  37.34 
 
 
242 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0410952  hitchhiker  0.00730194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2125  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.2 
 
 
254 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.47 
 
 
233 aa  132  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0298613  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2703  respiratory nitrate reductase gamma subunit  34.04 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304029  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2632  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.47 
 
 
230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2589  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.44 
 
 
255 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3867  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.19 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.26 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0272  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.05 
 
 
241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2894  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.89 
 
 
240 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104655  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0296  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.05 
 
 
241 aa  125  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1406  respiratory nitrate reductase gamma subunit  32.16 
 
 
232 aa  125  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3758  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.6 
 
 
264 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1705  respiratory nitrate reductase gamma subunit  31.87 
 
 
239 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.06964  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2880  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.78 
 
 
225 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2795  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.47 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2312  respiratory nitrate reductase gamma subunit  33.62 
 
 
225 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01205  nitrate reductase 1, gamma (cytochrome b(NR)) subunit  33.9 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.372615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01215  hypothetical protein  33.9 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.316454  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1892  respiratory nitrate reductase subunit gamma  33.48 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.644939  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1562  respiratory nitrate reductase gamma subunit  33.48 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.995386 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1956  respiratory nitrate reductase subunit gamma  33.48 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817539  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1897  respiratory nitrate reductase subunit gamma  33.48 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.017842  normal  0.804398 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1337  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.9 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00180394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1378  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.9 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653452  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2396  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.9 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178622 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1912  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  33.9 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0870039  normal  0.196031 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1395  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  33.9 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1711  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  33.9 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.163334  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.47 
 
 
225 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1379  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.48 
 
 
225 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.477496  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03844  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.04 
 
 
227 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4592  respiratory nitrate reductase gamma subunit  31.62 
 
 
239 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2517  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.19 
 
 
227 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189452  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1333  respiratory nitrate reductase gamma subunit  31.76 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1584  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.43 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000863008  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0778  nitrate reductase gamma subunit  34.78 
 
 
225 aa  115  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.379399  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2561  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.62 
 
 
229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.40821  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5386  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.06 
 
 
227 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.338397  normal  0.0191932 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2256  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.89 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0442548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0332  respiratory nitrate reductase gamma subunit  32.89 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000138371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3445  nitrate reductase, gamma subunit  34.78 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0664  respiratory nitrate reductase gamma subunit  31.12 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340042  normal  0.55355 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5005  respiratory nitrate reductase gamma subunit  31.2 
 
 
227 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1112  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.02 
 
 
245 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01423  nitrate reductase 2 (NRZ), gamma subunit  31.14 
 
 
226 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2182  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.14 
 
 
226 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.292963  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2305  respiratory nitrate reductase gamma subunit  31.76 
 
 
227 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.369875  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2075  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  31.14 
 
 
226 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0439  respiratory nitrate reductase gamma subunit  31.02 
 
 
244 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00872281  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01435  hypothetical protein  31.14 
 
 
226 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1549  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.14 
 
 
226 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1646  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.14 
 
 
226 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2191  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.14 
 
 
226 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0430  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.02 
 
 
244 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>