158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2312 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2312  respiratory nitrate reductase gamma subunit  100 
 
 
225 aa  459  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1562  respiratory nitrate reductase gamma subunit  89.78 
 
 
225 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.995386 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1897  respiratory nitrate reductase subunit gamma  89.78 
 
 
225 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.017842  normal  0.804398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1379  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  89.33 
 
 
225 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.477496  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1956  respiratory nitrate reductase subunit gamma  89.78 
 
 
225 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817539  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1892  respiratory nitrate reductase subunit gamma  89.78 
 
 
225 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.644939  normal  0.075518 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01205  nitrate reductase 1, gamma (cytochrome b(NR)) subunit  87.56 
 
 
225 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.372615  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  87.11 
 
 
225 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1711  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  87.56 
 
 
225 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.163334  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01215  hypothetical protein  87.56 
 
 
225 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.316454  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1395  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  87.56 
 
 
225 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1337  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  87.56 
 
 
225 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00180394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1378  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  87.56 
 
 
225 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653452  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2396  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  87.56 
 
 
225 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178622 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1912  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  87.56 
 
 
225 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0870039  normal  0.196031 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1856  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  82.67 
 
 
225 aa  398  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2880  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  82.22 
 
 
225 aa  394  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1774  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  80 
 
 
225 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079326  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2256  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  76.89 
 
 
234 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0442548  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2561  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  76.34 
 
 
229 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.40821  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1581  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  75.11 
 
 
226 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.214627  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1697  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  75.11 
 
 
226 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1695  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  74.67 
 
 
226 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.953876 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1762  respiratory nitrate reductase 2 gamma subunit  75.11 
 
 
226 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1758  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  74.67 
 
 
226 aa  358  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351215  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01423  nitrate reductase 2 (NRZ), gamma subunit  73.33 
 
 
226 aa  354  5e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2182  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  73.33 
 
 
226 aa  354  5e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.292963  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01435  hypothetical protein  73.33 
 
 
226 aa  354  5e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1549  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  73.33 
 
 
226 aa  354  5e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1646  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  73.33 
 
 
226 aa  354  5e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2075  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  73.33 
 
 
226 aa  354  5e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2191  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  73.33 
 
 
226 aa  354  5e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2305  respiratory nitrate reductase gamma subunit  72.89 
 
 
227 aa  354  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.369875  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2065  respiratory nitrate reductase gamma subunit  76.89 
 
 
226 aa  353  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2229  respiratory nitrate reductase gamma subunit  72.44 
 
 
227 aa  350  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125271  normal  0.0229196 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1709  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  75.11 
 
 
226 aa  344  8e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.996367  normal  0.284092 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1333  respiratory nitrate reductase gamma subunit  58.93 
 
 
225 aa  290  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  53.6 
 
 
235 aa  252  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3083  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  53.78 
 
 
226 aa  247  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.49935  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2795  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  52.86 
 
 
244 aa  242  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0430  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  53.78 
 
 
244 aa  242  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13830  respiratory nitrate reductase gamma chain  55.41 
 
 
227 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.792747  normal  0.19596 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0439  respiratory nitrate reductase gamma subunit  53.33 
 
 
244 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00872281  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1237  respiratory nitrate reductase gamma chain  54.95 
 
 
227 aa  240  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1957  nitrate reductase  50.22 
 
 
225 aa  240  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  52 
 
 
233 aa  238  5e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  53.57 
 
 
233 aa  231  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0298613  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3867  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  52.86 
 
 
257 aa  228  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0272  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  51.33 
 
 
241 aa  227  9e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3758  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  52.86 
 
 
264 aa  227  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2589  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  51.34 
 
 
255 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2631  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  50.67 
 
 
225 aa  227  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997723  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0296  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  51.33 
 
 
241 aa  226  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4592  respiratory nitrate reductase gamma subunit  50.66 
 
 
239 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2894  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  51.98 
 
 
240 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104655  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1112  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  51.33 
 
 
245 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0608  respiratory nitrate reductase gamma subunit  48 
 
 
241 aa  221  7e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2125  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  50.45 
 
 
254 aa  221  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  52.29 
 
 
254 aa  221  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0669  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.22 
 
 
241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0113371  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03844  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  50 
 
 
227 aa  217  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1000  respiratory nitrate reductase gamma subunit  47.77 
 
 
231 aa  216  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2632  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  48.23 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6187  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  48.89 
 
 
242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0410952  hitchhiker  0.00730194 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2703  respiratory nitrate reductase gamma subunit  49.33 
 
 
234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304029  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2517  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.11 
 
 
227 aa  210  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189452  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1705  respiratory nitrate reductase gamma subunit  49.34 
 
 
239 aa  209  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.06964  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5386  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  45.78 
 
 
227 aa  205  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.338397  normal  0.0191932 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1584  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  45.78 
 
 
238 aa  201  9e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000863008  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1734  nitrate reductase, gamma subunit  46.49 
 
 
228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2761  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.49 
 
 
228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0941659  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0664  respiratory nitrate reductase gamma subunit  49.55 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340042  normal  0.55355 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2244  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.49 
 
 
228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0745666  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3074  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.49 
 
 
228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.523041  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2628  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.49 
 
 
228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591566  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2684  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.49 
 
 
228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1517  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.49 
 
 
228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.133049  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1851  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.05 
 
 
228 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0977  respiratory nitrate reductase transmembrane protein  48.46 
 
 
227 aa  198  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5005  respiratory nitrate reductase gamma subunit  48.46 
 
 
227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144628  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1406  respiratory nitrate reductase gamma subunit  47.16 
 
 
232 aa  196  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1252  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  48 
 
 
227 aa  192  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2077  respiratory nitrate reductase subunit gamma  48.02 
 
 
227 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0152156  normal  0.186259 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3595  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  50.22 
 
 
227 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0903735  normal  0.288208 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4672  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  50.22 
 
 
227 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0119  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  44.89 
 
 
227 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1627  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  44.89 
 
 
227 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.474726  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1542  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  44.89 
 
 
227 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5708  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.32 
 
 
227 aa  184  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6461  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.32 
 
 
227 aa  184  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153995  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.38 
 
 
225 aa  141  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2466  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.38 
 
 
225 aa  141  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1984  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.48 
 
 
225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1974  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.98 
 
 
229 aa  135  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3402  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.68 
 
 
229 aa  135  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1528  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.08 
 
 
234 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000209931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2278  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.96 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.339538  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1957  nitrate reductase, gamma subunit  34.07 
 
 
228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0223608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1935  nitrate reductase, gamma subunit  34.07 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.840407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2138  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.08 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>