150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1827 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1827  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  100 
 
 
246 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.259695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2806  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  70.37 
 
 
248 aa  359  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.460402  normal  0.0323748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5444  Nitrate reductase  63.6 
 
 
242 aa  317  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3141  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  62.92 
 
 
253 aa  300  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.172601  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4475  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  60.5 
 
 
241 aa  290  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.323862 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3702  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  59.24 
 
 
248 aa  289  4e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1921  Nitrate reductase  58.16 
 
 
240 aa  285  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1349  respiratory nitrate reductase gamma subunit  55.65 
 
 
242 aa  284  7e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1260  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  57.02 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259966  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3672  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  58.09 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167763  normal  0.110852 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1277  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  57.02 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1286  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  56.61 
 
 
243 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.65257  normal  0.0385137 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0903  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  58.09 
 
 
243 aa  281  5.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1760  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  62.61 
 
 
251 aa  280  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0317  respiratory nitrate reductase gamma subunit  56.79 
 
 
260 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2159  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  55.37 
 
 
243 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11754  nitrate reductase narX  57.63 
 
 
652 aa  280  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0308508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4543  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  55.37 
 
 
243 aa  278  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.290259 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18690  respiratory nitrate reductase gamma subunit  55.56 
 
 
243 aa  276  3e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.073165  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4426  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  55.14 
 
 
250 aa  262  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.325203  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11189  respiratory nitrate reductase gamma subunit narI  55.23 
 
 
246 aa  260  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5210  respiratory nitrate reductase subunit gamma  55.88 
 
 
244 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1974  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  48.87 
 
 
229 aa  227  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2037  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  50.85 
 
 
233 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3177  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.56 
 
 
229 aa  224  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2161  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.11 
 
 
229 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1980  respiratory nitrate reductase subunit gamma  47.11 
 
 
229 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.689777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2128  respiratory nitrate reductase subunit gamma  47.11 
 
 
229 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.833335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2138  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.56 
 
 
229 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2278  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  48.42 
 
 
229 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.339538  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1957  nitrate reductase, gamma subunit  47.11 
 
 
228 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0223608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1935  nitrate reductase, gamma subunit  47.51 
 
 
229 aa  222  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.840407  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0180  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  51.13 
 
 
247 aa  223  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363972  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3402  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  48.42 
 
 
229 aa  222  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1238  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  48.39 
 
 
238 aa  214  9e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.361113 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1528  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.93 
 
 
234 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000209931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  44.8 
 
 
225 aa  205  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2466  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  44.8 
 
 
225 aa  205  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.19 
 
 
234 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1488  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  48.65 
 
 
585 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0506  respiratory nitrate reductase gamma subunit  44.39 
 
 
250 aa  198  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.273339 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1984  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  41.63 
 
 
225 aa  198  7e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1208  respiratory nitrate reductase gamma subunit  46.05 
 
 
260 aa  198  7e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.787753  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0195  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  49.54 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.026405 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0778  nitrate reductase gamma subunit  34.06 
 
 
225 aa  123  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.379399  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2632  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.89 
 
 
230 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3445  nitrate reductase, gamma subunit  33.94 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2125  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.8 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6187  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.62 
 
 
242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0410952  hitchhiker  0.00730194 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0332  respiratory nitrate reductase gamma subunit  32.34 
 
 
231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000138371 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1333  respiratory nitrate reductase gamma subunit  33.04 
 
 
225 aa  118  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1406  respiratory nitrate reductase gamma subunit  35.84 
 
 
232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2703  respiratory nitrate reductase gamma subunit  33.78 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304029  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.44 
 
 
233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.14 
 
 
233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0298613  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0272  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.74 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2589  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.47 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0296  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.74 
 
 
241 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2894  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.75 
 
 
240 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104655  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1957  nitrate reductase  32.14 
 
 
225 aa  109  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5386  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.42 
 
 
227 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.338397  normal  0.0191932 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.82 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2795  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.38 
 
 
244 aa  105  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5005  respiratory nitrate reductase gamma subunit  32.74 
 
 
227 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0206  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.63 
 
 
222 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03844  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.22 
 
 
227 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0977  respiratory nitrate reductase transmembrane protein  32.47 
 
 
227 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2631  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.18 
 
 
225 aa  102  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997723  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2517  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.15 
 
 
227 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189452  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3758  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.91 
 
 
264 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2256  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.74 
 
 
234 aa  99.8  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0442548  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0669  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.83 
 
 
241 aa  99.8  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0113371  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2561  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.74 
 
 
229 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.40821  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13830  respiratory nitrate reductase gamma chain  31.72 
 
 
227 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.792747  normal  0.19596 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1705  respiratory nitrate reductase gamma subunit  30.94 
 
 
239 aa  98.6  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.06964  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1584  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.96 
 
 
238 aa  98.2  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000863008  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0608  respiratory nitrate reductase gamma subunit  27.27 
 
 
241 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0247  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.8 
 
 
248 aa  97.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.373624  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0439  respiratory nitrate reductase gamma subunit  32.3 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00872281  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1237  respiratory nitrate reductase gamma chain  31.28 
 
 
227 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2077  respiratory nitrate reductase subunit gamma  32.58 
 
 
227 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0152156  normal  0.186259 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5708  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.39 
 
 
227 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6461  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.39 
 
 
227 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153995  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0430  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.3 
 
 
244 aa  95.9  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2305  respiratory nitrate reductase gamma subunit  31.36 
 
 
227 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.369875  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.41 
 
 
235 aa  95.1  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1734  nitrate reductase, gamma subunit  33.03 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2761  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.03 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0941659  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1897  respiratory nitrate reductase subunit gamma  31.51 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.017842  normal  0.804398 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1851  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.03 
 
 
228 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1695  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  28.19 
 
 
226 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.953876 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1562  respiratory nitrate reductase gamma subunit  31.51 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.995386 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2244  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.03 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0745666  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3074  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.03 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.523041  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2684  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.03 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1517  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.03 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.133049  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1956  respiratory nitrate reductase subunit gamma  31.51 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817539  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1774  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.77 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079326  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1892  respiratory nitrate reductase subunit gamma  31.51 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.644939  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1856  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.65 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>