151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0195 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0195  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  100 
 
 
247 aa  488  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.026405 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0180  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  91.5 
 
 
247 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363972  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2037  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  64.38 
 
 
233 aa  288  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1349  respiratory nitrate reductase gamma subunit  55.79 
 
 
242 aa  263  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1238  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  54.51 
 
 
238 aa  258  5.0000000000000005e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.361113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5444  Nitrate reductase  52.38 
 
 
242 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3141  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.74 
 
 
253 aa  238  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.172601  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2806  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  48.36 
 
 
248 aa  236  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.460402  normal  0.0323748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3672  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  49.36 
 
 
243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167763  normal  0.110852 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0903  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  50.42 
 
 
243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0506  respiratory nitrate reductase gamma subunit  48.21 
 
 
250 aa  231  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.273339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1760  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  52.27 
 
 
251 aa  229  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4475  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.32 
 
 
241 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.323862 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1528  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.52 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000209931  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11754  nitrate reductase narX  47.56 
 
 
652 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0308508 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18690  respiratory nitrate reductase gamma subunit  47.62 
 
 
243 aa  218  5e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.073165  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1827  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  48.26 
 
 
246 aa  218  7e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.259695  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1208  respiratory nitrate reductase gamma subunit  48.25 
 
 
260 aa  216  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.787753  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1488  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  49.31 
 
 
585 aa  216  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1984  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  43.5 
 
 
225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3702  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  44.35 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1974  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  44.14 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  42.6 
 
 
225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2466  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  42.6 
 
 
225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1921  Nitrate reductase  47.25 
 
 
240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1980  respiratory nitrate reductase subunit gamma  42.79 
 
 
229 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.689777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2128  respiratory nitrate reductase subunit gamma  42.79 
 
 
229 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.833335  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2159  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.82 
 
 
243 aa  211  9e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817555 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1957  nitrate reductase, gamma subunit  42.79 
 
 
228 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0223608  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1260  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.73 
 
 
243 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259966  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1277  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.73 
 
 
243 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2161  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  42.79 
 
 
229 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4543  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.61 
 
 
243 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.290259 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3402  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  44.14 
 
 
229 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2278  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  42.34 
 
 
229 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.339538  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1935  nitrate reductase, gamma subunit  42.34 
 
 
229 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.840407  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1286  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.27 
 
 
243 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.65257  normal  0.0385137 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2138  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  42.79 
 
 
229 aa  209  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.05 
 
 
234 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3177  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  41.89 
 
 
229 aa  206  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0317  respiratory nitrate reductase gamma subunit  45.29 
 
 
260 aa  202  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4426  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  48.98 
 
 
250 aa  202  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.325203  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11189  respiratory nitrate reductase gamma subunit narI  44.3 
 
 
246 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5210  respiratory nitrate reductase subunit gamma  42.15 
 
 
244 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6187  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  37.44 
 
 
242 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0410952  hitchhiker  0.00730194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2589  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  38.96 
 
 
255 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1584  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  40.87 
 
 
238 aa  142  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000863008  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2125  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  39.09 
 
 
254 aa  142  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1406  respiratory nitrate reductase gamma subunit  38.5 
 
 
232 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.93 
 
 
233 aa  138  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0298613  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36.89 
 
 
254 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2894  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36.28 
 
 
240 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104655  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2256  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36.07 
 
 
234 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0442548  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2561  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36.07 
 
 
229 aa  132  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.40821  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5386  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  38.16 
 
 
227 aa  131  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.338397  normal  0.0191932 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0272  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.9 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2632  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.5 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2517  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  39.27 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189452  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0296  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.62 
 
 
241 aa  129  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.48 
 
 
235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2795  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  37.66 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4592  respiratory nitrate reductase gamma subunit  36.25 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2305  respiratory nitrate reductase gamma subunit  34.09 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.369875  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1705  respiratory nitrate reductase gamma subunit  36.12 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.06964  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1851  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  37.17 
 
 
228 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2229  respiratory nitrate reductase gamma subunit  34.55 
 
 
227 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125271  normal  0.0229196 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1957  nitrate reductase  33.93 
 
 
225 aa  126  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2703  respiratory nitrate reductase gamma subunit  33.91 
 
 
234 aa  125  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304029  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3867  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36.59 
 
 
257 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1774  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.32 
 
 
225 aa  125  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079326  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0977  respiratory nitrate reductase transmembrane protein  37.05 
 
 
227 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1333  respiratory nitrate reductase gamma subunit  35.27 
 
 
225 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.78 
 
 
233 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1000  respiratory nitrate reductase gamma subunit  31.98 
 
 
231 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1734  nitrate reductase, gamma subunit  36.28 
 
 
228 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2761  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36.28 
 
 
228 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0941659  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2244  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36.28 
 
 
228 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0745666  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3074  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36.28 
 
 
228 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.523041  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2684  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36.28 
 
 
228 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1517  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36.28 
 
 
228 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.133049  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1856  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.86 
 
 
225 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2880  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.74 
 
 
225 aa  122  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01423  nitrate reductase 2 (NRZ), gamma subunit  32.59 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2182  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.59 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.292963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2075  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  32.59 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5708  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  38.01 
 
 
227 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0439  respiratory nitrate reductase gamma subunit  36.13 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00872281  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01435  hypothetical protein  32.59 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2628  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.84 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1549  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.59 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1646  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.59 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2191  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.59 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6461  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  38.01 
 
 
227 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153995  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0778  nitrate reductase gamma subunit  38.57 
 
 
225 aa  119  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.379399  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3758  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.19 
 
 
264 aa  119  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03844  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.51 
 
 
227 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0430  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36.13 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2312  respiratory nitrate reductase gamma subunit  31.42 
 
 
225 aa  119  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2065  respiratory nitrate reductase gamma subunit  34.38 
 
 
226 aa  118  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01215  hypothetical protein  32.3 
 
 
225 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.316454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>