150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2806 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2806  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  100 
 
 		 248 aa  493  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.460402  normal  0.0323748 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1827  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  70.37 
 
 		 246 aa  359  2e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.259695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5444  Nitrate reductase  63.79 
 
 		 242 aa  316  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3141  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  62.65 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.172601  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1760  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  66.4 
 
 		 251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1349  respiratory nitrate reductase gamma subunit  59 
 
 		 242 aa  298  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3702  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  58.94 
 
 		 248 aa  292  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3672  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  60.41 
 
 		 243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167763  normal  0.110852 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0903  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  59.59 
 
 		 243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11754  nitrate reductase narX  58.55 
 
 		 652 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0308508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1921  Nitrate reductase  58.26 
 
 		 240 aa  281  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0317  respiratory nitrate reductase gamma subunit  56.05 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2159  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  57.61 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4543  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  56.79 
 
 		 243 aa  279  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1286  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  57.2 
 
 		 243 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.65257  normal  0.0385137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1260  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  56.79 
 
 		 243 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259966  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1277  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  56.79 
 
 		 243 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4475  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  56.36 
 
 		 241 aa  261  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.323862 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4426  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  54.32 
 
 		 250 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.325203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18690  respiratory nitrate reductase gamma subunit  53.72 
 
 		 243 aa  260  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.073165  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0180  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  50.83 
 
 		 247 aa  250  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11189  respiratory nitrate reductase gamma subunit narI  53.14 
 
 		 246 aa  250  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5210  respiratory nitrate reductase subunit gamma  53.36 
 
 		 244 aa  234  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2037  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  52.14 
 
 		 233 aa  228  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1238  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  50.45 
 
 		 238 aa  228  9e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.361113 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1974  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  48.87 
 
 		 229 aa  221  9e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0195  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  50.45 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.026405 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1957  nitrate reductase, gamma subunit  47.96 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0223608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3177  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  48.42 
 
 		 229 aa  219  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2161  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.96 
 
 		 229 aa  218  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1980  respiratory nitrate reductase subunit gamma  47.96 
 
 		 229 aa  218  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.689777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2128  respiratory nitrate reductase subunit gamma  47.96 
 
 		 229 aa  218  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.833335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2278  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.96 
 
 		 229 aa  218  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.339538  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1935  nitrate reductase, gamma subunit  47.96 
 
 		 229 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.840407  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1488  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  51.75 
 
 		 585 aa  216  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2138  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.96 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3402  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.51 
 
 		 229 aa  214  8e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1528  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  49.32 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000209931  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  49.55 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0506  respiratory nitrate reductase gamma subunit  45.75 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.273339 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  43.24 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2466  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  43.24 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1208  respiratory nitrate reductase gamma subunit  44.83 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.787753  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1984  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  41.63 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6187  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  37.05 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0410952  hitchhiker  0.00730194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2125  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36.36 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1406  respiratory nitrate reductase gamma subunit  34.36 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  38.1 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2589  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  37.27 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2632  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.74 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.27 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0778  nitrate reductase gamma subunit  35.32 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.379399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1333  respiratory nitrate reductase gamma subunit  34.08 
 
 		 225 aa  119  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4592  respiratory nitrate reductase gamma subunit  32.93 
 
 		 239 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3445  nitrate reductase, gamma subunit  34.4 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.11 
 
 		 233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0298613  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2561  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.92 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.40821  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2256  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.92 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0442548  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03844  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.03 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2703  respiratory nitrate reductase gamma subunit  35.32 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304029  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3758  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.33 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5386  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.29 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.338397  normal  0.0191932 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2894  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.19 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104655  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0296  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.64 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0272  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.64 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1957  nitrate reductase  30.67 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2312  respiratory nitrate reductase gamma subunit  33.05 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2631  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.8 
 
 		 225 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997723  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5005  respiratory nitrate reductase gamma subunit  32.17 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144628  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2305  respiratory nitrate reductase gamma subunit  33.03 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.369875  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2795  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.84 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1584  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.08 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000863008  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0977  respiratory nitrate reductase transmembrane protein  33.19 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2229  respiratory nitrate reductase gamma subunit  33.03 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125271  normal  0.0229196 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1774  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.89 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079326  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2880  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.22 
 
 		 225 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2517  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.04 
 
 		 227 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189452  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.77 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01205  nitrate reductase 1, gamma (cytochrome b(NR)) subunit  31.33 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.372615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01215  hypothetical protein  31.33 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.316454  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1711  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  31.33 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.163334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1000  respiratory nitrate reductase gamma subunit  29.96 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1337  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.33 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00180394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1378  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.33 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653452  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2396  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.33 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178622 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1912  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  31.33 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0870039  normal  0.196031 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1395  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  31.33 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.9 
 
 		 225 aa  102  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01423  nitrate reductase 2 (NRZ), gamma subunit  31.72 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2182  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.72 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.292963  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5708  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.18 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1695  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  30.84 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.953876 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2075  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  31.72 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1549  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.72 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1646  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.72 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01435  hypothetical protein  31.72 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2191  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.72 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6461  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.18 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1762  respiratory nitrate reductase 2 gamma subunit  30.22 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1892  respiratory nitrate reductase subunit gamma  31.33 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.644939  normal  0.075518 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>