168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1488 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1488  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  100 
 
 
585 aa  1122    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2037  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  51.87 
 
 
233 aa  237  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0180  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  49.32 
 
 
247 aa  237  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363972  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0506  respiratory nitrate reductase gamma subunit  53.75 
 
 
250 aa  237  5.0000000000000005e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.273339 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2806  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  51.75 
 
 
248 aa  234  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.460402  normal  0.0323748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5444  Nitrate reductase  50.45 
 
 
242 aa  233  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1349  respiratory nitrate reductase gamma subunit  50.23 
 
 
242 aa  231  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0903  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  52.21 
 
 
243 aa  224  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3672  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  51.33 
 
 
243 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167763  normal  0.110852 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0195  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  49.07 
 
 
247 aa  220  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.026405 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1238  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.61 
 
 
238 aa  218  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.361113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3141  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.32 
 
 
253 aa  217  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.172601  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1528  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.49 
 
 
234 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000209931  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1827  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  48.65 
 
 
246 aa  216  9e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.259695  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.3 
 
 
234 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1760  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  51.15 
 
 
251 aa  209  8e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2159  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  49.54 
 
 
243 aa  207  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11754  nitrate reductase narX  48.89 
 
 
652 aa  207  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0308508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4543  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  48.17 
 
 
243 aa  207  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.290259 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3702  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.06 
 
 
248 aa  206  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3402  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  42.92 
 
 
229 aa  206  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1974  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  42.86 
 
 
229 aa  205  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1935  nitrate reductase, gamma subunit  41.96 
 
 
229 aa  204  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.840407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3177  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  41.52 
 
 
229 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2138  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  41.52 
 
 
229 aa  201  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4475  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  43.72 
 
 
241 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.323862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1980  respiratory nitrate reductase subunit gamma  41.52 
 
 
229 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.689777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2128  respiratory nitrate reductase subunit gamma  41.52 
 
 
229 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.833335  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11189  respiratory nitrate reductase gamma subunit narI  47.83 
 
 
246 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2161  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  41.07 
 
 
229 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18690  respiratory nitrate reductase gamma subunit  47.93 
 
 
243 aa  200  6e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.073165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1957  nitrate reductase, gamma subunit  41.07 
 
 
228 aa  200  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0223608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2278  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  42.01 
 
 
229 aa  199  9e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.339538  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1260  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.71 
 
 
243 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259966  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1277  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.71 
 
 
243 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1286  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  47.25 
 
 
243 aa  198  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.65257  normal  0.0385137 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0317  respiratory nitrate reductase gamma subunit  47.71 
 
 
260 aa  195  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  41.1 
 
 
225 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2466  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  41.1 
 
 
225 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1208  respiratory nitrate reductase gamma subunit  46.22 
 
 
260 aa  194  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.787753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1921  Nitrate reductase  44.55 
 
 
240 aa  193  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1984  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  38.36 
 
 
225 aa  191  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4426  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  46.61 
 
 
250 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.325203  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5210  respiratory nitrate reductase subunit gamma  43.24 
 
 
244 aa  171  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5803  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  38.41 
 
 
429 aa  157  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2125  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36.89 
 
 
254 aa  136  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  37.56 
 
 
233 aa  134  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0298613  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36.41 
 
 
233 aa  134  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2589  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.92 
 
 
255 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.44 
 
 
254 aa  131  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2632  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.13 
 
 
230 aa  127  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1406  respiratory nitrate reductase gamma subunit  36.07 
 
 
232 aa  126  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6187  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.91 
 
 
242 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0410952  hitchhiker  0.00730194 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1705  respiratory nitrate reductase gamma subunit  33.48 
 
 
239 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.06964  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1584  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.17 
 
 
238 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000863008  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2312  respiratory nitrate reductase gamma subunit  35.59 
 
 
225 aa  116  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1379  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.63 
 
 
225 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.477496  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1892  respiratory nitrate reductase subunit gamma  33.63 
 
 
225 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.644939  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1956  respiratory nitrate reductase subunit gamma  33.63 
 
 
225 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817539  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2703  respiratory nitrate reductase gamma subunit  34.67 
 
 
234 aa  115  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304029  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1562  respiratory nitrate reductase gamma subunit  33.63 
 
 
225 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.995386 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1897  respiratory nitrate reductase subunit gamma  33.63 
 
 
225 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.017842  normal  0.804398 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2880  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.18 
 
 
225 aa  114  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03844  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.11 
 
 
227 aa  113  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1774  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.74 
 
 
225 aa  113  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079326  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2305  respiratory nitrate reductase gamma subunit  32.43 
 
 
227 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.369875  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1000  respiratory nitrate reductase gamma subunit  32.88 
 
 
231 aa  111  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01205  nitrate reductase 1, gamma (cytochrome b(NR)) subunit  34.98 
 
 
225 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.372615  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1711  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  34.98 
 
 
225 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.163334  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1395  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  34.98 
 
 
225 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1337  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.98 
 
 
225 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00180394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1378  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.98 
 
 
225 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653452  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5386  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.57 
 
 
227 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.338397  normal  0.0191932 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2396  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.98 
 
 
225 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178622 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01215  hypothetical protein  34.98 
 
 
225 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.316454  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1912  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  34.98 
 
 
225 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0870039  normal  0.196031 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.53 
 
 
225 aa  110  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2229  respiratory nitrate reductase gamma subunit  32.43 
 
 
227 aa  110  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125271  normal  0.0229196 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0296  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.77 
 
 
241 aa  110  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.61 
 
 
235 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0272  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.77 
 
 
241 aa  109  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2517  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.13 
 
 
227 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189452  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1856  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.23 
 
 
225 aa  108  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2256  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.72 
 
 
234 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0442548  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1957  nitrate reductase  30.41 
 
 
225 aa  107  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2561  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.58 
 
 
229 aa  107  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.40821  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01423  nitrate reductase 2 (NRZ), gamma subunit  31.28 
 
 
226 aa  107  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2182  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.28 
 
 
226 aa  107  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.292963  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01435  hypothetical protein  31.28 
 
 
226 aa  107  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2075  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  31.28 
 
 
226 aa  107  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1549  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.28 
 
 
226 aa  107  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1646  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.28 
 
 
226 aa  107  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2191  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.28 
 
 
226 aa  107  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1758  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  30.84 
 
 
226 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351215  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0119  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.88 
 
 
227 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1697  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  30.84 
 
 
226 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4592  respiratory nitrate reductase gamma subunit  32.57 
 
 
239 aa  106  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1581  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  30.84 
 
 
226 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.214627  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1627  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.88 
 
 
227 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.474726  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1542  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.88 
 
 
227 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>